66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3866 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3866  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  988    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000713597  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3715  nitroreductase  34.78 
 
 		 214 aa  89.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0229  nitroreductase  38.34 
 
 		 202 aa  85.9  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.04731  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0441  nitroreductase  29.82 
 
 		 246 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0283265  normal  0.303699 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2599  nitroreductase  37.44 
 
 		 225 aa  76.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.0000000444768  hitchhiker  0.00002147 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2962  hypothetical protein  32.2 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.22169  normal  0.0766183 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1619  nitroreductase  27.45 
 
 		 221 aa  72.8  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0586  nitroreductase  30.14 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0997  SagB-type dehydrogenase domain protein  29.25 
 
 		 341 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1749  nitroreductase  25.33 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.774092  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0958  hypothetical protein  26.07 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.146916  normal  0.402436 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4625  nitroreductase  30.88 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0543  hypothetical protein  28.04 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4195  nitroreductase  33.56 
 
 		 259 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0355  nitroreductase  31.17 
 
 		 253 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0765561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5355  hypothetical protein  31.25 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00756623  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1974  hypothetical protein  27.67 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.529303 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4200  hypothetical protein  29.29 
 
 		 336 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3018  hypothetical protein  27.67 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1158  nitroreductase  27.7 
 
 		 251 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0520  hypothetical protein  27.72 
 
 		 473 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0200  nitroreductase  30.41 
 
 		 259 aa  57.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0343927  normal  0.0613797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2035  nitroreductase  30.89 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0318  nitroreductase  32.65 
 
 		 239 aa  57  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1590  nitroreductase  26.64 
 
 		 253 aa  57  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.208638  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0824  nitroreductase family protein  27.41 
 
 		 205 aa  57  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.50926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0893  nitroreductase  24.17 
 
 		 236 aa  57  0.0000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.000576269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_728  nitroreductase  27.69 
 
 		 205 aa  57  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0254  nitroreductase  25.58 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.68058 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2755  nitroreductase  29.44 
 
 		 248 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1675  nitroreductase  32.34 
 
 		 274 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000196792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5327  hypothetical protein  25.82 
 
 		 278 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.432063 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1491  hypothetical protein  26.71 
 
 		 357 aa  55.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.197933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0924  hypothetical protein  29.41 
 
 		 340 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.812313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1688  nitroreductase  30.88 
 
 		 249 aa  54.7  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0743  nitroreductase  26.84 
 
 		 189 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.203204  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0636  nitroreductase  30.35 
 
 		 237 aa  54.7  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00236475  hitchhiker  0.0000377907 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0819  hypothetical protein  28.63 
 
 		 252 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0243  hypothetical protein  26.48 
 
 		 255 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.06 
 
 		 1148 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0678  nitroreductase  28.74 
 
 		 242 aa  51.6  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1547  nitroreductase  30.85 
 
 		 234 aa  52  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00195434 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2154  hypothetical protein  28.57 
 
 		 510 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.569069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6177  nitroreductase  30.37 
 
 		 375 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0915  hypothetical protein  31.66 
 
 		 354 aa  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1137  nitroreductase  26.21 
 
 		 256 aa  49.3  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.33474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0691  nitroreductase  31.69 
 
 		 356 aa  48.9  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3382  nitroreductase  25.37 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1478  nitroreductase  30.92 
 
 		 235 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4188  nitroreductase  30.66 
 
 		 508 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3966  hypothetical protein  28.95 
 
 		 491 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.584107 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4227  nitroreductase  30.66 
 
 		 508 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0248141  normal  0.115527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1730  SagB-type dehydrogenase domain-containing protein  28.57 
 
 		 509 aa  47  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.871344  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1424  nitroreductase  25 
 
 		 252 aa  47  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09420  nitroreductase  30.21 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0780  SagB-type dehydrogenase domain protein  28.09 
 
 		 244 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4337  hypothetical protein  25.19 
 
 		 523 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.519761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1474  nitroreductase  26.98 
 
 		 251 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.027208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2555  hypothetical protein  24.48 
 
 		 257 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2630  nitroreductase family protein  26.55 
 
 		 257 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00137993  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2329  nitroreductase  25 
 
 		 255 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14975  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2359  hypothetical protein  23.2 
 
 		 475 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2877  nitroreductase  26.25 
 
 		 203 aa  44.3  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2124  hypothetical protein  26.9 
 
 		 518 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.754194  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2592  amino acid adenylation domain protein  28.02 
 
 		 2454 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0413  NADH oxidase  24.51 
 
 		 371 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000291832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>