More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3804 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3804  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  100 
 
 
141 aa  281  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.602111  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3032  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  52.9 
 
 
143 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.921134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3513  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  53.19 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22810  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  46.48 
 
 
149 aa  124  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.489543 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3450  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  46.1 
 
 
146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.138812  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2020  protein of unknown function UPF0074  46.98 
 
 
177 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0707899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0422  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  48.57 
 
 
155 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0640  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
149 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3203  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  47.37 
 
 
143 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0358  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  48.63 
 
 
151 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53378 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03520  rrf2 family protein, putative transcriptional regulator  45.58 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1064  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  40.91 
 
 
143 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3383  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.06 
 
 
155 aa  107  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3220  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 
150 aa  105  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3073  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  43.7 
 
 
148 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00965194  normal  0.580811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.76 
 
 
156 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0536  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  44.36 
 
 
143 aa  103  8e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.315603  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0915  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.43 
 
 
153 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0932  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  41.43 
 
 
153 aa  102  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3453  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.69 
 
 
148 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.879628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0943  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.14 
 
 
153 aa  101  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0101  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
146 aa  100  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.464439  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0631  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  34.35 
 
 
147 aa  100  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0937  transcriptional regulator, TrmB  36.81 
 
 
175 aa  94.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.901092 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2223  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.17 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.339527  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3286  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.78 
 
 
159 aa  92  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5030  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2272  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.257031  normal  0.323507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3397  hypothetical protein  38.06 
 
 
172 aa  90.9  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3608  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.78 
 
 
159 aa  90.5  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1758  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.03 
 
 
172 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.106493 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.78 
 
 
171 aa  89.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0669  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.416555  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2375  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.3 
 
 
166 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.727332 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1447  Rrf2 family protein  35.21 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0973586  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1425  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.5 
 
 
161 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0574582  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1812  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.91 
 
 
166 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.502319  normal  0.154118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3494  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  37.32 
 
 
183 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1786  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.96 
 
 
172 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2967  hypothetical protein  33.33 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3071  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.75 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0569291  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2510  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  34.81 
 
 
166 aa  87.4  7e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3163  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.81 
 
 
166 aa  87  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.878205  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2600  hypothetical protein  30.6 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3040  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.46 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.323158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3492  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.59 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0412  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  39.69 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1660  transcriptional regulator  34.56 
 
 
150 aa  85.9  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278304 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1790  Rrf2 family protein  38.97 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4724  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  42.11 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3024  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  39.42 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1131  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.07 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6231  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.88 
 
 
171 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1848  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.88 
 
 
171 aa  84.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0421  iron-responsive transcriptional regulator  39.46 
 
 
160 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0531604  hitchhiker  0.00267682 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0528  iron-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0854  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  40.62 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0962468 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1872  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.88 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628801  hitchhiker  0.000127972 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0562  iron-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23721  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0389  iron-responsive transcriptional regulator  38.78 
 
 
160 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00187363  normal  0.229909 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1534  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353948  normal  0.464781 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2888  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1513  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.55 
 
 
146 aa  83.6  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.334315 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2830  Rrf2 family protein  39.42 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2406  Rrf2 family protein  39.42 
 
 
162 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2710  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2883  Rrf2 family protein  39.42 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2768  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 
162 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1719  putative transcriptional regulator  39.42 
 
 
162 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.149273  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0606  Rrf2 family protein  39.42 
 
 
165 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2456  hypothetical protein  29.1 
 
 
143 aa  82  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0149  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  38.89 
 
 
167 aa  82  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0743  hypothetical protein  36.09 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00086  transcriptional repressor NsrR  34.78 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3617  iron-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
153 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.973931  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2769  transcriptional repressor NsrR  34.62 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0361  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00329253 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002267  nitrite-sensitive transcriptional repressor NsrR  34.78 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4785  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.124056  normal  0.626622 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2014  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  37.12 
 
 
156 aa  80.1  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4645  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3810  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  32.06 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.209804  normal  0.479131 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1800  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  34.35 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0930  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  33.58 
 
 
150 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276668  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4635  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4024  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family protein  31.34 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.89096  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4221  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.38 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04045  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.11 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.58974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3647  transcriptional repressor NsrR  34.88 
 
 
141 aa  78.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3365  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  35.66 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.312723  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2545  transcriptional regulator, BadM/Rrf2 family  36.36 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0787  transcriptional repressor NsrR  34.29 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.959014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3835  transcriptional repressor NsrR  34.11 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.678572  hitchhiker  0.00000129464 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04007  hypothetical protein  34.11 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.7208  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2401  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.64 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4421  transcriptional repressor NsrR  34.11 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3642  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  36.62 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0315634 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4737  transcriptional repressor NsrR  34.11 
 
 
141 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1789  BadM/Rrf2 family transcriptional regulator  35.16 
 
 
147 aa  78.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4728  transcriptional repressor NsrR  34.11 
 
 
162 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.462578  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>