More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3708 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  61.02 
 
 		 556 aa  653    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  65.62 
 
 		 552 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 521 aa  1056    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  58.48 
 
 		 564 aa  630  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  54.63 
 
 		 548 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  55.15 
 
 		 559 aa  589  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  55.58 
 
 		 563 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  55.43 
 
 		 559 aa  587  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  54.01 
 
 		 548 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  54.01 
 
 		 558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  54.79 
 
 		 559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  54.79 
 
 		 559 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  48.98 
 
 		 553 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  48.61 
 
 		 553 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  47.69 
 
 		 553 aa  525  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  47.51 
 
 		 544 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  49.08 
 
 		 554 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  47.7 
 
 		 554 aa  512  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  46.35 
 
 		 543 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  48.71 
 
 		 554 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  47.23 
 
 		 554 aa  505  9.999999999999999e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  46.78 
 
 		 555 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  46.21 
 
 		 541 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  46.3 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  42.22 
 
 		 570 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  43.01 
 
 		 579 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  42.59 
 
 		 540 aa  442  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  41.12 
 
 		 551 aa  421  1e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  39.85 
 
 		 548 aa  410  1e-113  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  41.19 
 
 		 556 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  42.36 
 
 		 1121 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0541  trehalose synthase  40.94 
 
 		 1061 aa  405  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00661441  normal  0.174056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  37.96 
 
 		 1113 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  40.59 
 
 		 606 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  40.65 
 
 		 1093 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  40.07 
 
 		 1088 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  39.74 
 
 		 1123 aa  400  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  40.77 
 
 		 1111 aa  395  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2310  trehalose synthase  41.7 
 
 		 1098 aa  396  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.178439  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  39.93 
 
 		 1095 aa  396  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  39.82 
 
 		 562 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  40.59 
 
 		 1100 aa  395  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  40.48 
 
 		 1093 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  39.19 
 
 		 1109 aa  395  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  40.15 
 
 		 591 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  40.07 
 
 		 567 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5564  alpha-glucosidase  39.35 
 
 		 1100 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.657284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  39.23 
 
 		 1085 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  42.44 
 
 		 544 aa  391  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  40.85 
 
 		 601 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  40.44 
 
 		 1114 aa  392  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  40.22 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  37.91 
 
 		 1100 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  39.71 
 
 		 1088 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  38.93 
 
 		 1102 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  40.48 
 
 		 1112 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  39.19 
 
 		 1100 aa  386  1e-106  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  39.56 
 
 		 1088 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  40.37 
 
 		 1099 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  39.71 
 
 		 1088 aa  387  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  40.77 
 
 		 1137 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  39.71 
 
 		 1088 aa  386  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  40.77 
 
 		 1137 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  40.22 
 
 		 1137 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  39.82 
 
 		 598 aa  387  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  40.77 
 
 		 1137 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  40.22 
 
 		 1137 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  38.78 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  38.7 
 
 		 1102 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  39.67 
 
 		 1108 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  39.74 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  39.32 
 
 		 1116 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  39.49 
 
 		 1108 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  38.64 
 
 		 1104 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  40.41 
 
 		 1138 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  40.59 
 
 		 1136 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  38.28 
 
 		 1100 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  38 
 
 		 1100 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  38.28 
 
 		 1092 aa  383  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  40.57 
 
 		 1121 aa  384  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  39.49 
 
 		 682 aa  385  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  39.56 
 
 		 1139 aa  382  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  39.59 
 
 		 1102 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  40.59 
 
 		 1131 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  38.75 
 
 		 1152 aa  382  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  40.41 
 
 		 1131 aa  379  1e-104  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1208  alpha amylase  38.48 
 
 		 1094 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  38.56 
 
 		 1100 aa  379  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  39.56 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  38.93 
 
 		 1101 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  39.56 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  39.56 
 
 		 572 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  37.55 
 
 		 1112 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  40.52 
 
 		 1164 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  38.93 
 
 		 1154 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  39.19 
 
 		 1088 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  40.16 
 
 		 1121 aa  380  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2536  trehalose synthase  40.97 
 
 		 1098 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.605311  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  40.59 
 
 		 1131 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  39.23 
 
 		 1142 aa  380  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>