More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3682 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3964  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 		 3089 aa  829    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3745  KR domain protein  39.82 
 
 		 1520 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0978  Beta-ketoacyl synthase  37.55 
 
 		 1653 aa  858    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2106  hypothetical protein  31.59 
 
 		 2316 aa  702    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1612  Beta-ketoacyl synthase  42.89 
 
 		 1424 aa  726    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.509341  hitchhiker  0.00723495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3096  Beta-ketoacyl synthase  42.33 
 
 		 995 aa  713    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4834  Beta-ketoacyl synthase  42.91 
 
 		 1646 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560935  normal  0.0357231 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3967  Beta-ketoacyl synthase  39.09 
 
 		 3093 aa  822    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1831  Beta-ketoacyl synthase  38.76 
 
 		 1574 aa  896    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1781  Beta-ketoacyl synthase  39.3 
 
 		 1408 aa  653    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7000  Beta-ketoacyl synthase  38.37 
 
 		 4647 aa  764    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4755  Beta-ketoacyl synthase  39.43 
 
 		 1560 aa  773    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.173311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3962  Beta-ketoacyl synthase  38.2 
 
 		 1582 aa  860    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0573  KR domain protein  36.78 
 
 		 1833 aa  747    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0834  polyketide synthase  31.82 
 
 		 1612 aa  732    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.399353  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2400  beta-ketoacyl synthase  36.88 
 
 		 2150 aa  723    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.586894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1161  polyketide synthase  31.76 
 
 		 1612 aa  729    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  42.18 
 
 		 1466 aa  682    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3963  Beta-ketoacyl synthase  38.62 
 
 		 3090 aa  816    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3821  beta-ketoacyl synthase  42.73 
 
 		 1909 aa  681    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3965  Beta-ketoacyl synthase  39.34 
 
 		 4646 aa  827    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0836  beta-ketoacyl synthase  38.2 
 
 		 2093 aa  723    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3966  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 		 3108 aa  820    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2416  Beta-ketoacyl synthase  42.16 
 
 		 1302 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1966  erythronolide synthase  42.96 
 
 		 1911 aa  875    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0640418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3732  beta-ketoacyl synthase  39.77 
 
 		 1535 aa  812    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0148321  normal  0.340666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0846  amino acid adenylation domain-containing protein  42.52 
 
 		 2710 aa  661    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3682  KR domain protein  100 
 
 		 1497 aa  2946    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.631324  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1247  amino acid adenylation domain protein  44.98 
 
 		 2684 aa  645    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1860  Beta-ketoacyl synthase  33.62 
 
 		 1416 aa  669    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.699288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2423  polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  41.37 
 
 		 1795 aa  791    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.328938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1969  Beta-ketoacyl synthase  49.04 
 
 		 2498 aa  732    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.88904  normal  0.0132465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3961  Beta-ketoacyl synthase  38.85 
 
 		 3130 aa  842    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3025  Beta-ketoacyl synthase  42.33 
 
 		 995 aa  716    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7309  polyketide synthase  33.88 
 
 		 1486 aa  633  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4911  Beta-ketoacyl synthase  42.93 
 
 		 1466 aa  634  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000703058  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2034  amino acid adenylation domain protein  39.27 
 
 		 2176 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12949  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsE  42.64 
 
 		 1488 aa  627  1e-178  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.892857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.9 
 
 		 2551 aa  616  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3390  beta-ketoacyl synthase  41.99 
 
 		 1489 aa  617  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100261  normal  0.176956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1672  amino acid adenylation domain-containing protein  43.84 
 
 		 3335 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0886652 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  41.02 
 
 		 2273 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  41.81 
 
 		 4186 aa  609  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2580  amino acid adenylation domain-containing protein  40.77 
 
 		 2679 aa  606  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3123  beta-ketoacyl synthase  40.65 
 
 		 1470 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2861  beta-ketoacyl synthase  39.71 
 
 		 1472 aa  593  1e-168  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2832  beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 		 1472 aa  593  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789961  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1336  Beta-ketoacyl synthase  32.94 
 
 		 1465 aa  591  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2876  beta-ketoacyl synthase  39.61 
 
 		 1472 aa  593  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.119773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2072  Beta-ketoacyl synthase  35.87 
 
 		 2243 aa  591  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3761  amino acid adenylation domain protein  42.04 
 
 		 2682 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.674004  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4055  Beta-ketoacyl synthase  42.74 
 
 		 974 aa  579  1.0000000000000001e-163  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.285495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3184  amino acid adenylation domain protein  41.49 
 
 		 2454 aa  576  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  41.99 
 
 		 2604 aa  572  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2330  Beta-ketoacyl synthase  43.91 
 
 		 1000 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.26 
 
 		 2762 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3099  6-deoxyerythronolide-B synthase  30.74 
 
 		 1559 aa  566  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.692721 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  30.81 
 
 		 1559 aa  566  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1648  polyketide synthase, type I  32.64 
 
 		 1528 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.5134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1567  polyketide synthase, type I  32.62 
 
 		 1530 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0139  TubF protein  32.55 
 
 		 1530 aa  557  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1234  JamP  31.67 
 
 		 1524 aa  558  1e-157  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.581024  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.62 
 
 		 4239 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1709  non-ribosomal peptide synthase  44.62 
 
 		 4265 aa  552  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  37 
 
 		 2880 aa  550  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  35.13 
 
 		 3427 aa  550  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1795  syringomycin synthetase  44.62 
 
 		 4265 aa  552  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1021  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.65 
 
 		 3133 aa  529  1e-148  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3193  Beta-ketoacyl synthase  29.25 
 
 		 3099 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0298  thiotemplate mechanism natural product synthetase  44.65 
 
 		 3127 aa  528  1e-148  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.86 
 
 		 3092 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1608  amino acid adenylation  38.3 
 
 		 3194 aa  515  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  37.06 
 
 		 1656 aa  513  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.63 
 
 		 1587 aa  512  1e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  35.39 
 
 		 3158 aa  510  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2654  beta-ketoacyl synthase  40.98 
 
 		 2226 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.261151  normal  0.360138 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  34.43 
 
 		 1354 aa  503  1e-141  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  34.53 
 
 		 1087 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  35.46 
 
 		 2462 aa  506  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2600  yersiniabactin polyketide/non-ribosomal peptide synthetase  39.87 
 
 		 3173 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  34.86 
 
 		 2551 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  38.46 
 
 		 4478 aa  503  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  41.46 
 
 		 6889 aa  498  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  35.71 
 
 		 1337 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 		 1874 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  31.96 
 
 		 3679 aa  485  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2435  beta-ketoacyl synthase  38.54 
 
 		 3275 aa  479  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  34.42 
 
 		 7279 aa  476  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  38.15 
 
 		 3696 aa  476  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  37.49 
 
 		 3163 aa  472  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2971  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase., 6- deoxyerythronolide-B synthase  39.35 
 
 		 3424 aa  473  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000594073 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.82 
 
 		 1816 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.42 
 
 		 7110 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  39.41 
 
 		 4080 aa  470  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  48.31 
 
 		 3235 aa  470  9.999999999999999e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  42.05 
 
 		 3148 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.7 
 
 		 5400 aa  469  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 5154 aa  464  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1978  beta-ketoacyl synthase  45.51 
 
 		 926 aa  466  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.690285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.17 
 
 		 3676 aa  464  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>