More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3630 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  100 
 
 
291 aa  561  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  48.57 
 
 
319 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  45.39 
 
 
305 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1955  methyltransferase type 11  37.88 
 
 
219 aa  105  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  37.95 
 
 
232 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  32.6 
 
 
207 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  26.23 
 
 
208 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  46.56 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  35.66 
 
 
210 aa  83.6  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  40.74 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  38.55 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  51.46 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  44.83 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  42.11 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 
233 aa  79  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  28.32 
 
 
629 aa  79  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  50.49 
 
 
246 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  50.49 
 
 
246 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.45 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  44.96 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  50 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  38.38 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  46.49 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00196  biotin synthesis protein  38.61 
 
 
232 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.505545  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  36.81 
 
 
244 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  41.84 
 
 
260 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  40.16 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  46.24 
 
 
262 aa  73.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  35.84 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  39.57 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 
226 aa  73.2  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  45.36 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  38 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  39.39 
 
 
207 aa  72.8  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  39.26 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  43.86 
 
 
217 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  47.71 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  34.44 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3572  Methyltransferase type 11  46.23 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  37.59 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
226 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  36.81 
 
 
244 aa  72  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  39.82 
 
 
265 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1437  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.33 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  43.33 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3776  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0393069  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.81 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1569  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.781622  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  36.36 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  42.2 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.21 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1423  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1395  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2436  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
268 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1534  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.190517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  39.46 
 
 
233 aa  70.5  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  36.42 
 
 
255 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  40.32 
 
 
347 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  39.02 
 
 
240 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000970326  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1607  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.61 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000707225 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  38.95 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.11 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  38.35 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  38.95 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  36.89 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  35.46 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  42 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  38.95 
 
 
267 aa  70.1  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  38.04 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  42.37 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  41 
 
 
429 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.7 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  43 
 
 
219 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 
209 aa  69.3  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  47.42 
 
 
457 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.36 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.25 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  41.35 
 
 
235 aa  68.6  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  44 
 
 
216 aa  68.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
262 aa  68.9  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.43 
 
 
236 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.88 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  35.77 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>