More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3575 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3575  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
416 aa  799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  26.09 
 
 
430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  28.09 
 
 
420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5069  putative transporter  26.19 
 
 
415 aa  123  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  28.89 
 
 
436 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  30.38 
 
 
435 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5212  major facilitator superfamily MFS_1  28.16 
 
 
408 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0948922  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5073  putative transporter  26.2 
 
 
415 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4642  transporter  26.53 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0174  putative transporter  26.32 
 
 
415 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  28.36 
 
 
446 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  28.61 
 
 
425 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 
433 aa  121  3e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4800  transporter  26.26 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4661  transporter  26.26 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5163  transporter  26.26 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5040  putative transporter  26.26 
 
 
415 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  26.45 
 
 
406 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0110  multidrug ABC transporter permease  27.53 
 
 
416 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  31.19 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4750  major facilitator transporter  26.74 
 
 
415 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  26.2 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  26.2 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 
420 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3024  putative permease  26.56 
 
 
406 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  26.2 
 
 
406 aa  117  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  27.84 
 
 
444 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2754  major facilitator transporter  34.41 
 
 
417 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.622633  normal  0.0858288 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  27.62 
 
 
440 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0532  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5067  transporter, putative  26.26 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25.88 
 
 
406 aa  114  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  30.17 
 
 
426 aa  114  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  27.56 
 
 
420 aa  114  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2984  putative permease  25.94 
 
 
404 aa  113  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000116191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  27.11 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  27.56 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
429 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  27.3 
 
 
401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  27.69 
 
 
399 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3555  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 
449 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.194127  normal  0.458265 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  25.61 
 
 
404 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  29.64 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  27.3 
 
 
420 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  27.3 
 
 
420 aa  110  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  27.14 
 
 
424 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  27.21 
 
 
420 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  31.29 
 
 
418 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  24.26 
 
 
403 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 
421 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2289  major facilitator transporter  28.57 
 
 
432 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.995339  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  27.48 
 
 
420 aa  107  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  28.71 
 
 
431 aa  107  5e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  27.32 
 
 
474 aa  107  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  27.18 
 
 
441 aa  107  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
441 aa  106  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  27.54 
 
 
447 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  31.05 
 
 
450 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  29.06 
 
 
474 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  28.62 
 
 
491 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  24.53 
 
 
405 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  24.53 
 
 
405 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  29.79 
 
 
412 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3541  major facilitator transporter  24.93 
 
 
415 aa  103  8e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  30.58 
 
 
426 aa  103  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3729  enterobactin exporter EntS  27.43 
 
 
426 aa  103  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.818592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  29.21 
 
 
450 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  30.4 
 
 
426 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  27.76 
 
 
432 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  26.84 
 
 
413 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1498  enterobactin exporter EntS  27.59 
 
 
432 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.201643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0885  major facilitator transporter  32.28 
 
 
415 aa  101  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  31.45 
 
 
413 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  27.01 
 
 
412 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  26.58 
 
 
420 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  28.13 
 
 
424 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4370  transporter, major facilitator family  24.87 
 
 
410 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  5.0052999999999995e-22 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 
431 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14790  Major Facilitator Superfamily transporter  32.12 
 
 
464 aa  100  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.13794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7785  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 
420 aa  100  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.157303 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
418 aa  99.8  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  28.82 
 
 
461 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
423 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4706  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 
445 aa  99  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.93667 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1327  enterobactin exporter EntS  28.29 
 
 
424 aa  97.8  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00590508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 
419 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3679  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.709991  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  27.81 
 
 
429 aa  97.4  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  31.52 
 
 
442 aa  97.1  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2989  putative permease  24.62 
 
 
362 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
476 aa  97.4  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
412 aa  96.7  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 
431 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  30.94 
 
 
431 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11210  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 
410 aa  95.5  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0772  major facilitator superfamily MFS_1  28.46 
 
 
431 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  30.88 
 
 
428 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  26.85 
 
 
417 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>