More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3523 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  100 
 
 
349 aa  696    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20020  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  73.99 
 
 
351 aa  502  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  69.63 
 
 
349 aa  498  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  67.05 
 
 
350 aa  465  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  65.9 
 
 
350 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2774  Luciferase-like monooxygenase  59.27 
 
 
350 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000162274  hitchhiker  0.000235272 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  55.69 
 
 
344 aa  345  7e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2945  Luciferase-like monooxygenase  46.96 
 
 
348 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000294064  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  48.93 
 
 
344 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  51.23 
 
 
339 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  48.66 
 
 
345 aa  296  4e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  48.8 
 
 
346 aa  295  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4515  putative F420-dependent oxidoreductase  49.54 
 
 
346 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1303  Luciferase-like monooxygenase  48.33 
 
 
339 aa  290  3e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0285765  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  46.97 
 
 
346 aa  289  4e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2798  luciferase family protein  50.15 
 
 
341 aa  289  4e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000196172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  49.85 
 
 
352 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2848  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  46.81 
 
 
346 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59341  normal  0.0111399 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2391  luciferase-like  48.94 
 
 
351 aa  285  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2599  luciferase family protein  50.15 
 
 
348 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.288347  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3812  putative F420-dependent oxidoreductase  48.94 
 
 
339 aa  281  9e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  47.88 
 
 
361 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  45.48 
 
 
349 aa  279  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  45.48 
 
 
349 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  45.48 
 
 
349 aa  279  5e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  47.94 
 
 
346 aa  279  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3409  luciferase family protein  50.15 
 
 
346 aa  279  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0981332 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0860  Luciferase-like monooxygenase  49.1 
 
 
342 aa  276  3e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3963  putative F420-dependent oxidoreductase  47.73 
 
 
345 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1108  Luciferase-like monooxygenase  47.42 
 
 
372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  45.29 
 
 
347 aa  269  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1386  putative F420-dependent oxidoreductase  49.24 
 
 
361 aa  269  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1539  luciferase family protein  44.87 
 
 
343 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5219  luciferase family protein  44.41 
 
 
343 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.195941 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  47.45 
 
 
355 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  43.7 
 
 
342 aa  263  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5649  Luciferase-like monooxygenase  43.6 
 
 
343 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0950  Luciferase-like monooxygenase  43.85 
 
 
372 aa  261  8.999999999999999e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  44.58 
 
 
345 aa  260  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  42.98 
 
 
343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  42.98 
 
 
343 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  42.98 
 
 
343 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2731  luciferase family protein  43.03 
 
 
352 aa  259  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  46.99 
 
 
346 aa  259  7e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1057  putative F420-dependent oxidoreductase  42.61 
 
 
354 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2504  putative F420-dependent oxidoreductase  42.4 
 
 
344 aa  255  8e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2713  luciferase family protein  45.56 
 
 
359 aa  255  9e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1519  luciferase-like protein  42.98 
 
 
349 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1542  luciferase family protein  42.98 
 
 
349 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.240997  normal  0.654342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6491  luciferase family protein  43.79 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.77 
 
 
336 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  35.51 
 
 
332 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  33.44 
 
 
333 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  34.67 
 
 
334 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  26.9 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0541  Luciferase-like, subgroup  31.33 
 
 
341 aa  137  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.764904  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4373  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.34 
 
 
327 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0274855  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  35.51 
 
 
335 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2923  Luciferase-like, subgroup  33.33 
 
 
327 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  34.48 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.03 
 
 
318 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1978  luciferase-like protein  28.57 
 
 
357 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0532  luciferase-like protein  32.81 
 
 
326 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  29.5 
 
 
360 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  31.54 
 
 
327 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6623  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  35.91 
 
 
333 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179887  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3213  luciferase-like protein  29.74 
 
 
340 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  29.26 
 
 
322 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3275  luciferase family protein  29.74 
 
 
340 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3224  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.74 
 
 
340 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.370073  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2761  luciferase-like  31.65 
 
 
353 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4065  luciferase family protein  30.6 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0254  methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.25 
 
 
328 aa  96.7  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0749  methylenetetrahydromethanopterin reductase  26.42 
 
 
323 aa  91.3  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.106334  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  28.1 
 
 
318 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2372  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.88 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  26.4 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  33.5 
 
 
347 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2852  luciferase family protein  34.1 
 
 
314 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.709446  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1073  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.9 
 
 
320 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1395  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.05 
 
 
326 aa  87  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4973  luciferase family protein  28.7 
 
 
360 aa  87  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0319  luciferase family protein  25.61 
 
 
349 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514626  normal  0.781231 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4588  luciferase family protein  25.95 
 
 
349 aa  85.9  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.8183  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2715  Luciferase-like monooxygenase  32.39 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3549  luciferase-like monooxygenase  30.81 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4112  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  28.79 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.273719  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3287  Luciferase-like, subgroup  28.48 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0118077  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6142  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  30.34 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44466  normal  0.207081 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4832  luciferase family protein  33.14 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827823  normal  0.86507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4583  luciferase family protein  25.61 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  28.02 
 
 
353 aa  82.8  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1630  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.38 
 
 
333 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1533  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  26.67 
 
 
323 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0482478  normal  0.0346737 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1055  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.411528  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0892  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.41 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0557  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.78 
 
 
335 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0316712  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0327  methylenetetrahydromethanopterin reductase  29.5 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.585505 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3948  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  25 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0406632  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1619  methylenetetrahydromethanopterin reductase  27.94 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>