More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3522 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  100 
 
 
274 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  56.94 
 
 
281 aa  311  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.07 
 
 
276 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.14 
 
 
278 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  58.48 
 
 
280 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  57.4 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  59.14 
 
 
278 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.88 
 
 
282 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.88 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  56.88 
 
 
276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.62 
 
 
276 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.76 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  55.94 
 
 
277 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  53.02 
 
 
281 aa  278  6e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.46 
 
 
292 aa  276  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  52.73 
 
 
277 aa  275  8e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  50.54 
 
 
279 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  53.45 
 
 
274 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  52.99 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  53.7 
 
 
290 aa  270  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  51.3 
 
 
386 aa  268  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  53.79 
 
 
277 aa  259  2e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  53.11 
 
 
290 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  50.91 
 
 
272 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  51.5 
 
 
290 aa  252  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  50.19 
 
 
285 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  52.92 
 
 
289 aa  249  5e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.31 
 
 
280 aa  244  6.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  46.45 
 
 
278 aa  243  3e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  48.55 
 
 
273 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  50 
 
 
300 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.74 
 
 
282 aa  237  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.15 
 
 
292 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  46.59 
 
 
278 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.58 
 
 
282 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  50.78 
 
 
281 aa  231  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.13 
 
 
282 aa  230  2e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.55 
 
 
294 aa  223  2e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.33 
 
 
282 aa  223  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.52 
 
 
283 aa  222  6e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  44.44 
 
 
278 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.11 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45.29 
 
 
282 aa  218  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  43.59 
 
 
320 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.56 
 
 
282 aa  210  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.13 
 
 
288 aa  210  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  43.53 
 
 
276 aa  206  4e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.62 
 
 
320 aa  205  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  47.91 
 
 
272 aa  205  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  46.18 
 
 
322 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  46.18 
 
 
322 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.8 
 
 
266 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2469  undecaprenyl-diphosphatase  39.5 
 
 
339 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.3 
 
 
266 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.88 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.97 
 
 
266 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
266 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
266 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
266 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
266 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.37 
 
 
266 aa  193  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.67 
 
 
266 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.44 
 
 
266 aa  192  6e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.8 
 
 
266 aa  191  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  46.09 
 
 
281 aa  188  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.93 
 
 
266 aa  188  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  42.75 
 
 
269 aa  186  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.51 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.43 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.43 
 
 
266 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
266 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.22 
 
 
266 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.44 
 
 
267 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
266 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
269 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  39.18 
 
 
267 aa  179  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.81 
 
 
267 aa  179  5.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  39.78 
 
 
261 aa  179  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.85 
 
 
272 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.67 
 
 
293 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1289  undecaprenyl-diphosphatase  39.02 
 
 
258 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.22 
 
 
283 aa  176  3e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.15 
 
 
267 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  39.77 
 
 
264 aa  175  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.78 
 
 
312 aa  175  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3641  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.7 
 
 
265 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  39.92 
 
 
266 aa  172  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  39.08 
 
 
272 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.75 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.26 
 
 
287 aa  171  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1039  undecaprenol kinase  40.46 
 
 
279 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
265 aa  171  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.69 
 
 
265 aa  169  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0458  undecaprenol kinase  38.64 
 
 
302 aa  169  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  39.31 
 
 
270 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0252  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.05 
 
 
279 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0294819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2835  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.85 
 
 
265 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  41.54 
 
 
261 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  40.29 
 
 
262 aa  167  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  39.21 
 
 
304 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>