22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3515 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3515  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 316 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5778  aminoglycoside phosphotransferase  52.52 
 
 		 316 aa  312  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5100  hypothetical protein  54.58 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.189048 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4715  hypothetical protein  53.85 
 
 		 309 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.27974  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4801  hypothetical protein  53.85 
 
 		 309 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5785  hypothetical protein  47.21 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1045  hypothetical protein  46.58 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  35.78 
 
 		 296 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0988  aminoglycoside phosphotransferase  36.24 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0869  aminoglycoside phosphotransferase  33.82 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  32.35 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  32.29 
 
 		 285 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  28.87 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  33.19 
 
 		 298 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  29.87 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  29.61 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  28.7 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  27.02 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  30.49 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  28.82 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  29.15 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>