More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3448 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3448  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 281 aa  541  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.327362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0825  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1304  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  24.86 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.407333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  35.83 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  29.11 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2660  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5257  transcriptional regulator, AraC family  34.66 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2202  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 287 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2483  AraC family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  27.88 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5387  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 279 aa  76.3  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1076  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0047  transcriptional regulator, AraC family  18.77 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.230347  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6692  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 260 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0676  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.11 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.425757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  24.9 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4151  transcriptional regulator, AraC family  28.5 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0354643  normal  0.109267 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  21.21 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0310  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0370  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3512  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0827399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1684  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.01 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.465215  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5627  transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  29.26 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  27.83 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6058  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  27.22 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2597  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00366269  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3504  transcriptional regulator, AraC family  25.98 
 
 		 281 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5515  transcriptional regulator, AraC family  21.89 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0529906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5791  transcriptional regulator, AraC family  29.56 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3797  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.101891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6610  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5306  transcriptional regulator, AraC family  36.94 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  20.54 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  23.26 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1479  helix-turn-helix domain-containing protein  28.57 
 
 		 299 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0993365  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 309 aa  65.1  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2318  AraC family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3305  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000908006 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1440  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4652  transcriptional regulator, AraC family  24.86 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.629583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  37.89 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3509  transcriptional regulator, AraC family  25.97 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.551098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1713  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2350  transcriptional regulator, AraC family  31.87 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0397043 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2108  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0188933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  30.92 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3502  transcriptional regulator, AraC family  23.35 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0575  transcriptional regulator, AraC family  35.47 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  32.61 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1656  transcriptional regulator, AraC family  36.2 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0328818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  30.98 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1671  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.68 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3282  transcriptional regulator, AraC family  23.3 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0185565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0497  helix-turn-helix domain-containing protein  22.65 
 
 		 263 aa  58.9  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.516029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4131  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 260 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.696726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2672  transcriptional regulator, AraC family  22.91 
 
 		 273 aa  58.5  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0546  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.493534  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0579  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4130  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 311 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0979  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560002  normal  0.0613388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1287  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.400393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3318  Helix-turn-helix, AraC domain protein  31.65 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47910  putative transcriptional regulator  32.58 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00926121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6449  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4602  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 279 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0287774  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0749  hypothetical protein  29.9 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1375  transcriptional regulator, AraC family  31.83 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.372829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4542  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.64 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 305 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2310  AraC family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 256 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.141971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  26.72 
 
 		 131 aa  54.7  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0433  transcriptional regulator, AraC family  28.15 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  28.92 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  34.62 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2336  hypothetical protein  26.73 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.429257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1833  helix-turn-helix domain-containing protein  23.53 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0887778  normal  0.832681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>