More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3443 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3443  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 525 aa  971    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000281945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37240  ADP-ribose pyrophosphatase  46.92 
 
 		 136 aa  122  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1138  NUDIX hydrolase  38.41 
 
 		 140 aa  96.7  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  36.8 
 
 		 133 aa  83.2  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1259  hypothetical protein  37.14 
 
 		 153 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1148  hypothetical protein  40.16 
 
 		 143 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000504849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  29.77 
 
 		 565 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 395 aa  70.9  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1775  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 166 aa  68.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4170  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 151 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2701  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0393532  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0605  NUDIX hydrolase  37.62 
 
 		 147 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 197 aa  63.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1502  NUDIX hydrolase  47.83 
 
 		 139 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.519776 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1293  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.180985  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1482  NUDIX family protein  36 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0365982  normal  0.462774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0227  mutator mutT protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase family protein  37.25 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.199837  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1590  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 		 154 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1017  NUDIX family protein  36.36 
 
 		 139 aa  60.1  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.686526  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0403  mutator MutT protein  37.25 
 
 		 329 aa  59.7  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0220424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1508  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 132 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2861  NUDIX hydrolase  48.21 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.510666  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1615  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 		 154 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5041  NUDIX hydrolase  49.21 
 
 		 148 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.216707 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0195  ADP-ribose pyrophosphatase  45.76 
 
 		 148 aa  57  0.0000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6519  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 159 aa  57  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.052102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1499  Mut/nudix family protein, putative isopentenyl-diphosphate isomerase  33.06 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.38166e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0038  mutator MutT protein  47.27 
 
 		 158 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.934517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1038  NUDIX hydrolase  43.86 
 
 		 144 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.38743 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0094  NUDIX hydrolase  32.93 
 
 		 170 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.126747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  44.07 
 
 		 172 aa  54.3  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 395 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2569  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 145 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0391668  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2755  mutT/nudix family protein  26.67 
 
 		 145 aa  53.9  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.801064  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10531  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 141 aa  53.9  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0128  NUDIX hydrolase  48 
 
 		 139 aa  53.9  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0968691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2789  mutT/nudix family protein  25.93 
 
 		 145 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000364509  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1974  MutT/nudix family protein  36.67 
 
 		 152 aa  53.5  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1436  NUDIX hydrolase  35.79 
 
 		 141 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  34.07 
 
 		 150 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1108  mutT/nudix family protein  39.19 
 
 		 149 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.979518  normal  0.39926 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  34.09 
 
 		 159 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  34.09 
 
 		 159 aa  53.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  41.67 
 
 		 156 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4130  mutT/nudix family protein  39.19 
 
 		 149 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000966346  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  30.53 
 
 		 172 aa  52.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202592 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07147  MFS tranporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06830)  24.34 
 
 		 474 aa  52  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.745622 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3925  NUDIX hydrolase  34.41 
 
 		 155 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0241724  normal  0.572778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0680  major facilitator superfamily MFS_1  21.5 
 
 		 384 aa  51.6  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.668541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2076  major facilitator superfamily MFS_1  23.55 
 
 		 419 aa  52  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 135 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1884  nucleotide phosphate derivative pyrophosphohydrolases, MutT/nudix family protein  32.99 
 
 		 163 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.187986  normal  0.072132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2763  mutT/nudix family protein  25.76 
 
 		 145 aa  52  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000181576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0781  mutator MutT protein  38.03 
 
 		 317 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0134531  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 240 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 239 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  60 
 
 		 239 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3404  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 174 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1950  hypothetical protein  44.9 
 
 		 145 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00937035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2852  NUDIX hydrolase  36.23 
 
 		 157 aa  50.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000177474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23100  hypothetical protein  44.9 
 
 		 145 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.691399  hitchhiker  0.00085888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.21 
 
 		 347 aa  50.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4229  NUDIX hydrolase  31.18 
 
 		 150 aa  50.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0351267  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  32.61 
 
 		 147 aa  50.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1300  NUDIX family hydrolase  51.22 
 
 		 118 aa  50.8  0.00007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.898276  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  34.21 
 
 		 151 aa  50.4  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0356  mutator MutT protein  36.23 
 
 		 136 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17470  ADP-ribose pyrophosphatase  43.55 
 
 		 205 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.580494  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 183 aa  50.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3853  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 149 aa  50.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.785148  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0882  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  38.89 
 
 		 216 aa  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4151  mutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 149 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0315306  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3933  mutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 161 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3766  MutT/Nudix family protein  37.84 
 
 		 161 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3781  MutT/Nudix family protein  37.84 
 
 		 161 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1608  NUDIX hydrolase  49.06 
 
 		 137 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5556  NUDIX hydrolase  32.14 
 
 		 130 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.239043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0250  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 		 367 aa  50.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.651007  normal  0.954901 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4241  mutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 161 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.602945  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1230  NUDIX hydrolase  41.67 
 
 		 165 aa  50.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0523  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 133 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0864  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  37.04 
 
 		 216 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000108978  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  32.22 
 
 		 135 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4044  mutT/nudix family protein  37.84 
 
 		 149 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3231  NUDIX hydrolase  51.92 
 
 		 140 aa  49.3  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0830  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 291 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2490  MutT/Nudix family protein  25 
 
 		 145 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0847665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6207  putative NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.109267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0799  NUDIX hydrolase  32 
 
 		 148 aa  48.9  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.428384 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  54.05 
 
 		 140 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0449  dinucleoside polyphosphate hydrolase  36.78 
 
 		 187 aa  49.3  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  45.28 
 
 		 137 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  32.74 
 
 		 155 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0834  dinucleoside polyphosphate hydrolase  40.26 
 
 		 239 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.496439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0504  NUDIX hydrolase  37.7 
 
 		 101 aa  49.3  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7621  major facilitator superfamily permease  26.15 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.262333 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  56.52 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1043  NUDIX hydrolase  48.08 
 
 		 238 aa  48.5  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2525  MutT/Nudix family protein  25 
 
 		 145 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000393058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>