130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3394 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3394  protein of unknown function DUF470  100 
 
 
850 aa  1636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4377  hypothetical protein  43.97 
 
 
905 aa  587  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.947401  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4568  protein of unknown function DUF470  41.11 
 
 
839 aa  527  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2601  hypothetical protein  37.51 
 
 
877 aa  429  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00218331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2334  protein of unknown function DUF470  38.79 
 
 
844 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1364  hypothetical protein  35.95 
 
 
857 aa  382  1e-104  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1037  hypothetical protein  28.44 
 
 
852 aa  304  4.0000000000000003e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3572  protein of unknown function DUF470  46.25 
 
 
346 aa  288  2.9999999999999996e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4813  protein of unknown function DUF470  44.38 
 
 
723 aa  283  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3199  hypothetical protein  24.9 
 
 
556 aa  156  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00757676 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1005  protein of unknown function DUF470  25.24 
 
 
556 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0976  protein of unknown function DUF470  25.24 
 
 
556 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0824  hypothetical protein  26.46 
 
 
568 aa  137  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.896168  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7583  protein of unknown function DUF470  31.15 
 
 
597 aa  124  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.389483  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2515  lysyl-tRNA synthetase  30.63 
 
 
1118 aa  124  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889838  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2319  lysyl-tRNA synthetase  31.05 
 
 
1132 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4539  hypothetical protein  30.48 
 
 
896 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.574606  normal  0.530229 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0644  protein of unknown function DUF470  29.27 
 
 
850 aa  111  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.166613  hitchhiker  0.000476142 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  21.25 
 
 
851 aa  110  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3970  lysyl-tRNA synthetase  28.71 
 
 
1113 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  20.96 
 
 
851 aa  110  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1520  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.87 
 
 
859 aa  108  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3825  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.87 
 
 
859 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000241179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1194  hypothetical protein  27.3 
 
 
879 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.685135  normal  0.0802635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1347  hypothetical protein  22.87 
 
 
861 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1590  virulence factor MprF  22.87 
 
 
861 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0815094  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1375  virulence factor MprF  22.87 
 
 
861 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1348  hypothetical protein  22.87 
 
 
861 aa  106  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1486  virulence factor MprF  22.87 
 
 
861 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.272411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1388  hypothetical protein  22.58 
 
 
861 aa  106  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1626  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.87 
 
 
861 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1558  putative lysylphosphatidylglycerol synthetase MprF  22.87 
 
 
861 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000388659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  23.43 
 
 
862 aa  105  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2476  protein of unknown function DUF470  27.78 
 
 
578 aa  104  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1213  hypothetical protein  25.44 
 
 
863 aa  104  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1597  hypothetical protein  28.16 
 
 
877 aa  101  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.498807  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0379  lysyl-tRNA synthetase (class II)  22.15 
 
 
844 aa  100  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.646345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1189  hypothetical protein  21.83 
 
 
858 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1396  hypothetical protein  26.25 
 
 
880 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1243  hypothetical protein  24.73 
 
 
863 aa  100  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2930  protein of unknown function DUF470  27.6 
 
 
854 aa  100  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.58792  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3898  hypothetical protein  25.85 
 
 
871 aa  99  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.129662  normal  0.427904 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3991  hypothetical protein  26.25 
 
 
880 aa  98.6  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4793  hypothetical protein  28.7 
 
 
872 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0448007  normal  0.10998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4013  hypothetical protein  26.32 
 
 
880 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144886 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3161  hypothetical protein  25.54 
 
 
871 aa  95.9  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11780  lysyl-tRNA synthetase (class II)  27.27 
 
 
1147 aa  95.1  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105343  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4555  hypothetical protein  26.79 
 
 
346 aa  94.7  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6803  protein of unknown function DUF470  24.51 
 
 
592 aa  94.4  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1547  hypothetical protein  26.37 
 
 
656 aa  93.2  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.736781  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1202  hypothetical protein  26.69 
 
 
880 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0906  lysyl-tRNA synthetase  26.33 
 
 
1094 aa  92.4  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1066  protein of unknown function DUF470  23.55 
 
 
590 aa  92  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0261019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2257  hypothetical protein  28.45 
 
 
864 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.546481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  24.31 
 
 
861 aa  91.7  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1693  protein of unknown function DUF470  28.45 
 
 
844 aa  91.7  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.153321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1564  hypothetical protein  21.54 
 
 
569 aa  91.3  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.201819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8424  protein of unknown function DUF470  25 
 
 
701 aa  90.5  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3961  Protein regulated by acid pH  24.12 
 
 
870 aa  90.5  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1231  hypothetical protein  26.38 
 
 
880 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0755535  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2725  hypothetical protein  26.99 
 
 
855 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4216  hypothetical protein  26.69 
 
 
880 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0127  lysyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 
1138 aa  89.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1620  protein of unknown function DUF470  28.15 
 
 
844 aa  90.1  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1845  FmtC domain-containing protein  21.23 
 
 
395 aa  89  3e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0206  hypothetical protein  27.61 
 
 
599 aa  89  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.914985  normal  0.140787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2745  hypothetical protein  26.2 
 
 
643 aa  88.6  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3330  lysyl-tRNA synthetase  25.95 
 
 
1100 aa  88.6  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27282  normal  0.711465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52350  hypothetical protein  25.95 
 
 
881 aa  87.8  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.890769 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1219  hypothetical protein  20.87 
 
 
917 aa  87.4  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.316039  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11635  hypothetical protein  27.81 
 
 
484 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266215 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01770  oxacillin resistance-associated protein fmtc  26.39 
 
 
854 aa  86.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.61685  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4591  hypothetical protein  25.95 
 
 
881 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2661  Lysyl-tRNA synthetase (class II)-like protein  25.35 
 
 
1098 aa  84.7  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0688281  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3226  protein of unknown function DUF470  24.19 
 
 
867 aa  84.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.598284  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3544  lysyl-tRNA synthetase  24.27 
 
 
1101 aa  83.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.899884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1737  lysyl-tRNA synthetase  25.9 
 
 
1120 aa  82.4  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  21.48 
 
 
875 aa  82.8  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4106  protein of unknown function DUF470  23.38 
 
 
877 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.628735 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3993  protein of unknown function DUF470  23.38 
 
 
877 aa  82.4  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.463704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3521  protein of unknown function DUF470  24.12 
 
 
867 aa  81.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0528845  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11657  lysyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 
1172 aa  80.9  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.73947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2983  lysyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
1112 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3027  lysyl-tRNA synthetase  25.07 
 
 
1112 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18850  hypothetical protein  26.6 
 
 
876 aa  80.1  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2998  lysyl-tRNA synthetase  24.51 
 
 
1111 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.604901  normal  0.107077 
 
 
-
 
NC_003296  RS04799  hypothetical protein  22.74 
 
 
883 aa  78.6  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0255937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0064  lysyl-tRNA synthetase  25.76 
 
 
1100 aa  78.6  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.9544  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2880  hypothetical protein  24.76 
 
 
875 aa  78.2  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.91223  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3230  hypothetical protein  25.35 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.233684 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5951  hypothetical protein  22.91 
 
 
869 aa  77.4  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.235832 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1235  lysyl-tRNA synthetase (class II)  21.57 
 
 
851 aa  76.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1562  putative transmembrane protein  24.39 
 
 
866 aa  76.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354089  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3646  hypothetical protein  24.45 
 
 
872 aa  76.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1587  protein of unknown function DUF470  19.1 
 
 
813 aa  75.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1140  hypothetical protein  25 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5764  hypothetical protein  25.77 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0550  hypothetical protein  24.27 
 
 
880 aa  73.2  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000522518  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  24.5 
 
 
850 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0534  protein of unknown function DUF472  26.64 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>