More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3275 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 271 aa  549  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  55.6 
 
 		 279 aa  293  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  55.13 
 
 		 261 aa  281  9e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 287 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  41.45 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  38.28 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.26 
 
 		 274 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  39.25 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  39.52 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  30.88 
 
 		 287 aa  125  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  40.94 
 
 		 382 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.45 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.53 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  38.93 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.9 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  37.99 
 
 		 304 aa  104  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  30.43 
 
 		 377 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  40.27 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 286 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  32.4 
 
 		 280 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  31.72 
 
 		 342 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  34.27 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 279 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  33.33 
 
 		 377 aa  100  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  35.29 
 
 		 318 aa  99  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  35.33 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  41.67 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  32.4 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  43.12 
 
 		 392 aa  96.7  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  34.42 
 
 		 311 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  36.97 
 
 		 343 aa  94.7  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  35.2 
 
 		 310 aa  94  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  30.24 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  29.18 
 
 		 286 aa  92.8  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  28.4 
 
 		 365 aa  92.8  6e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 328 aa  92.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  34.67 
 
 		 310 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  34.02 
 
 		 280 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  34 
 
 		 311 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  34 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 264 aa  90.1  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  29.61 
 
 		 277 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  34.67 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  34.67 
 
 		 310 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  36.67 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 328 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 		 1012 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  31.63 
 
 		 310 aa  86.7  3e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  31.77 
 
 		 559 aa  87  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  38.4 
 
 		 208 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  33.87 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  36.28 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0172  methyltransferase type 11  32.6 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.69 
 
 		 330 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  27.78 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.07 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  31.38 
 
 		 295 aa  81.3  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  33.08 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2411  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 572 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  38.74 
 
 		 210 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  29.19 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  39.17 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 237 aa  75.9  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.66 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.14 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  38.24 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  49.54 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5351  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.560641 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.49 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2958  hypothetical protein  29.37 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  42.5 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  37.25 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  24.54 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  37.19 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  39.62 
 
 		 300 aa  72.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  25 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  30.5 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>