More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3205 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  100 
 
 
210 aa  416  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  59.33 
 
 
217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  56.67 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  56.07 
 
 
220 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  53.27 
 
 
203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  50.7 
 
 
217 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  50.75 
 
 
208 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  47.34 
 
 
209 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  46.89 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  47.42 
 
 
212 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  49.23 
 
 
218 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  45.37 
 
 
215 aa  159  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  44.55 
 
 
200 aa  153  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  44.5 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  45.36 
 
 
200 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  45.27 
 
 
232 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.3 
 
 
200 aa  131  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.06 
 
 
224 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  37 
 
 
210 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  44.02 
 
 
222 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  40.72 
 
 
197 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  37.81 
 
 
204 aa  118  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  40.4 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  37.5 
 
 
400 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  35.88 
 
 
222 aa  90.9  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  38.31 
 
 
214 aa  89  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  35.63 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
210 aa  82  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  43.97 
 
 
121 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  37.43 
 
 
199 aa  79  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.81 
 
 
222 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  42.24 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
225 aa  74.3  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  30.57 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  31.05 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  36.62 
 
 
227 aa  72.4  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1697  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.29 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0587723  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.8 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.65 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  33.8 
 
 
218 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  23.38 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  34.42 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  35.97 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0152  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
296 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  31.58 
 
 
280 aa  68.2  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  31.58 
 
 
280 aa  68.2  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  31.19 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  28.42 
 
 
211 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  30.32 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.32 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  33.13 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.25 
 
 
240 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  39 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  30.97 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  30.97 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.86 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.86 
 
 
226 aa  65.5  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  30.97 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.25 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.16 
 
 
200 aa  65.5  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  33.52 
 
 
199 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
262 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  28.79 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  30.97 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  30.32 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  30.32 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  34.87 
 
 
204 aa  64.7  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1566  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  31.33 
 
 
213 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.32 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  37.32 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
196 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  30.81 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 
196 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.13 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  34.48 
 
 
205 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.29 
 
 
263 aa  62.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  34.15 
 
 
201 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.71 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
246 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  35.42 
 
 
246 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  30.07 
 
 
267 aa  62  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
199 aa  62  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
226 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  32.35 
 
 
255 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  36.61 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
208 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  28.17 
 
 
376 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  28.78 
 
 
252 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.72 
 
 
235 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  31.37 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.3 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  31.25 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>