48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3145 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3145  B3/4 domain protein  100 
 
 		 240 aa  464  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02780  hypothetical protein  65.82 
 
 		 242 aa  293  1e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.675259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14530  hypothetical protein  66.36 
 
 		 222 aa  268  4e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.278523  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4932  B3/4 domain protein  50.65 
 
 		 228 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8283  hypothetical protein  47.64 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182929  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5071  B3/4 domain protein  44.25 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09810  hypothetical protein  48.15 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0911  hypothetical protein  47.49 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2889  B3/4 domain-containing protein  48.96 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3530  B3/4 domain-containing protein  41.47 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.314219 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1667  B3/4 domain-containing protein  41.63 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0922271 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1790  B3/4 domain protein  41.63 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.23323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1850  B3/4 domain-containing protein  41.63 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1788  B3/4 domain protein  40.67 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00972614  normal  0.283564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1486  B3/4 domain protein  40.67 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.275004  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2486  Solo B3/4 domain-containing protein  36.24 
 
 		 239 aa  136  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1040  hypothetical protein  31.8 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0178906  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf669  hypothetical protein  31.67 
 
 		 232 aa  115  6e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1176  B3/4 domain protein  36.36 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185017  normal  0.273713 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0928  B3/4 domain-containing protein  43.88 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.191069  normal  0.0846004 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0131  B3/4 domain protein  31.22 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1756  B3/4 domain-containing protein  32.61 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0178794  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06500  hypothetical protein  32.62 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000280748  normal  0.453475 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3065  hypothetical protein  35.78 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570745  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2162  hypothetical protein  27.43 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14900  hypothetical protein  31.72 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000192579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2690  B3/4 domain protein  34.62 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5108  B3/4 domain protein  33.51 
 
 		 230 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.809424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5725  B3/4 domain protein  32.98 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1912  B3/4 domain protein  23.58 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5429  phosphoenolpyruvate synthase  33.99 
 
 		 230 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01765  hypothetical protein  33.73 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73481  normal  0.164289 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1605  B3/4 domain protein  30.7 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000125396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3672  B3/4 domain protein  34.34 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2948  B3/4 domain protein  34.34 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.222758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2004  phosphoenolpyruvate synthase  29.45 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1201  B3/4 domain-containing protein  26.7 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  hitchhiker  0.00215136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1717  B3/4 domain protein  31.21 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0502  B3/4 domain protein  22.43 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1602  B3/4 domain-containing protein  27.64 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.172541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1676  B3/4 domain-containing protein  29.52 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1367  B3/4 domain protein  31.37 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0504  B3/4  31.3 
 
 		 213 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.333323  normal  0.47226 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2205  B3/4 domain protein  28.68 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0519  B3/4 domain-containing protein  29.37 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.015821  normal  0.0554264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1117  B3/4 domain-containing protein  28.67 
 
 		 216 aa  48.9  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.871418  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1790  phosphoenolpyruvate synthase  29.41 
 
 		 221 aa  48.5  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0241449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0592  B3/4 domain protein  36.78 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.557641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>