More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3041 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  68.41 
 
 
505 aa  652    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  100 
 
 
500 aa  970    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  65.16 
 
 
508 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  62.04 
 
 
498 aa  566  1e-160  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  58.63 
 
 
516 aa  556  1e-157  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  58.79 
 
 
510 aa  557  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  57.95 
 
 
509 aa  551  1e-155  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  57.34 
 
 
516 aa  541  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  57.52 
 
 
511 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  59.35 
 
 
499 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  45.56 
 
 
503 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  51.73 
 
 
504 aa  476  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  50.7 
 
 
505 aa  474  1e-132  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  48.37 
 
 
497 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  51.31 
 
 
501 aa  474  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  49.18 
 
 
861 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  51.83 
 
 
519 aa  459  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  47.7 
 
 
510 aa  455  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.35 
 
 
492 aa  449  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  41.26 
 
 
496 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  47.4 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  48.09 
 
 
537 aa  446  1.0000000000000001e-124  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  46.72 
 
 
524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  47.19 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  46.76 
 
 
511 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  50.61 
 
 
508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  47.4 
 
 
524 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.26 
 
 
511 aa  448  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  47.19 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  47.37 
 
 
511 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  46.31 
 
 
515 aa  442  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  48.16 
 
 
522 aa  444  1e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  47.61 
 
 
524 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  46.64 
 
 
503 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4527  D-ribose transporter ATP binding protein  44.56 
 
 
501 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0169315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0116  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.74 
 
 
492 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  50.3 
 
 
499 aa  437  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  44.76 
 
 
501 aa  436  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  45.9 
 
 
516 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  44.06 
 
 
512 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  45.49 
 
 
503 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  44.53 
 
 
495 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  47.13 
 
 
521 aa  431  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  45.36 
 
 
518 aa  428  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  43.64 
 
 
525 aa  429  1e-119  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  44.47 
 
 
511 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  46.18 
 
 
508 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  44.49 
 
 
504 aa  428  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0580  ABC transporter related  42.22 
 
 
508 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.677056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4174  D-ribose transporter ATP binding protein  44.02 
 
 
501 aa  430  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283711  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  46.42 
 
 
505 aa  430  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2279  ABC transporter related  45.97 
 
 
500 aa  429  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.488082  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  46.67 
 
 
512 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  44.58 
 
 
516 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03635  fused D-ribose transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  43.99 
 
 
501 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.483932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4218  ABC transporter related protein  43.99 
 
 
501 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 
525 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2172  ABC transporter-like  45.2 
 
 
517 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327318  normal  0.453102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  47.87 
 
 
497 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  42.31 
 
 
497 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  42.77 
 
 
494 aa  426  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3977  D-ribose transporter ATP binding protein  43.81 
 
 
501 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.443134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03580  hypothetical protein  43.99 
 
 
501 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3965  D-ribose transporter ATP binding protein  43.99 
 
 
501 aa  425  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4117  D-ribose transporter ATP binding protein  43.99 
 
 
501 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.159229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  43.52 
 
 
516 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4265  D-ribose transporter ATP binding protein  43.99 
 
 
501 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0146477  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.65 
 
 
494 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.23 
 
 
513 aa  428  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 
496 aa  422  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  43.52 
 
 
516 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  43.61 
 
 
501 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  43.49 
 
 
524 aa  423  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  44.47 
 
 
513 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  43.52 
 
 
501 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  43.52 
 
 
516 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  45.98 
 
 
523 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
494 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  45.75 
 
 
514 aa  424  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4245  D-ribose transporter ATP binding protein  43.79 
 
 
501 aa  423  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0036959 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 
494 aa  424  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  44.67 
 
 
513 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  44.56 
 
 
513 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  43.52 
 
 
516 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5185  D-ribose transporter ATP binding protein  43.99 
 
 
501 aa  424  1e-117  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0631054  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  46.34 
 
 
507 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  46.34 
 
 
507 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
494 aa  422  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1029  ABC transporter-related protein  45.73 
 
 
506 aa  421  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.724261 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2211  ABC transporter-related protein  45.29 
 
 
535 aa  422  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.139274 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  41.28 
 
 
501 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  46.34 
 
 
507 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  42.24 
 
 
496 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0796  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 
494 aa  419  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4608  ABC transporter related  47.09 
 
 
519 aa  421  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  43.7 
 
 
500 aa  420  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>