202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2986 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E4107  alpha-xylosidase YicI  54.8 
 
 
763 aa  842    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0320  alpha-xylosidase YicI  57.47 
 
 
775 aa  880    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2887  alpha-xylosidase YicI  57.51 
 
 
779 aa  822    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07505  Alpha-xylosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AW25]  50.69 
 
 
780 aa  728    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.763241  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0055  alpha-xylosidase YicI  55.32 
 
 
772 aa  858    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.353636 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2455  alpha-xylosidase YicI  54.98 
 
 
770 aa  858    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03514  predicted alpha-glucosidase  55.19 
 
 
772 aa  858    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.485788  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1763  alpha-xylosidase YicI  58.9 
 
 
760 aa  879    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.983763  normal  0.0245324 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0049  glycoside hydrolase family 31  55.32 
 
 
772 aa  858    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2986  alpha-xylosidase YicI  100 
 
 
749 aa  1524    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3966  alpha-xylosidase YicI  54.17 
 
 
772 aa  850    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4683  alpha-xylosidase YicI  65.86 
 
 
771 aa  1022    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00144447  normal  0.975878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2057  alpha-xylosidase YicI  57.14 
 
 
772 aa  917    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3999  alpha-xylosidase YicI  54.7 
 
 
772 aa  856    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03466  hypothetical protein  55.19 
 
 
772 aa  858    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498351  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0623  alpha-xylosidase YicI  56.4 
 
 
764 aa  874    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10130  family 31 glycosyl hydrolase, alpha-glucosidase  65.16 
 
 
766 aa  945    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0724432  normal  0.362992 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1244  alpha-xylosidase YicI  49.58 
 
 
712 aa  705    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.669712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01510  alpha-xylosidase YicI  62.39 
 
 
681 aa  842    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4075  alpha-xylosidase YicI  54.17 
 
 
772 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.397579  normal  0.758007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1323  alpha-xylosidase YicI  63.77 
 
 
760 aa  944    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5029  alpha-xylosidase YicI  54.3 
 
 
772 aa  848    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32530  Alpha-glucosidase II; Alpha-xylosidase  50.77 
 
 
823 aa  712    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.725216  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1194  glycoside hydrolase family 31  62.94 
 
 
804 aa  922    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1752  alpha-xylosidase YicI  60.13 
 
 
775 aa  894    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4135  alpha-xylosidase YicI  54.17 
 
 
772 aa  848    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0071  alpha-xylosidase YicI  55.03 
 
 
772 aa  861    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.290357  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0609  alpha-xylosidase YicI  58.48 
 
 
764 aa  872    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0413  alpha-xylosidase YicI  63.98 
 
 
763 aa  844    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3867  alpha-xylosidase YicI  55.05 
 
 
772 aa  857    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4160  alpha-xylosidase YicI  55.19 
 
 
772 aa  859    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1246  alpha-xylosidase YicI  62.35 
 
 
774 aa  955    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.758952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0218  alpha-xylosidase YicI  55.46 
 
 
780 aa  835    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0187  alpha-xylosidase YicI  61.35 
 
 
775 aa  935    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4927  glycoside hydrolase family 31  64.03 
 
 
777 aa  952    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606594  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3956  alpha-xylosidase YicI  54.17 
 
 
772 aa  852    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4029  alpha-xylosidase YicI  54.3 
 
 
772 aa  853    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0205936  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0073  alpha-glucosidase  42.71 
 
 
608 aa  484  1e-135  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2416  alpha-glucosidase  41.94 
 
 
760 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1613  putative alpha-glucosidase  39.45 
 
 
765 aa  462  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0503092  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1288  Alpha-glucosidase  42.13 
 
 
765 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0490  glycoside hydrolase family 31  38.12 
 
 
757 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1569  glycoside hydrolase family 31  38.1 
 
 
794 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0778  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
799 aa  377  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2605  Alpha-glucosidase  37.77 
 
 
795 aa  367  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2861  glycoside hydrolase family protein  34.57 
 
 
695 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0705  glycoside hydrolase family protein  37.34 
 
 
778 aa  347  6e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.149362  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl317  alpha glucosidase/alpha-xylosidase  29.95 
 
 
752 aa  311  2e-83  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000639186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0650  Alpha-glucosidase  30.02 
 
 
828 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.178818  normal  0.195512 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4430  Alpha-glucosidase  30.92 
 
 
836 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121046  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2099  Alpha-glucosidase  31.3 
 
 
803 aa  278  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1017  Alpha-glucosidase  30 
 
 
768 aa  276  9e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0362727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1683  Alpha-glucosidase  31.21 
 
 
779 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0704  Alpha-glucosidase  31.06 
 
 
770 aa  273  6e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0156  isoglycosyl hydrolase family protein  30.21 
 
 
755 aa  266  8e-70  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.138592  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19090  Alpha-glucosidase  28.98 
 
 
801 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00110521  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0521  Alpha-glucosidase  27.55 
 
 
779 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0650  Alpha-glucosidase  27.93 
 
 
776 aa  259  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.379007  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1729  alpha-glucosidase  28.1 
 
 
792 aa  259  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3309  Alpha-glucosidase  27.53 
 
 
821 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.154266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3099  Alpha-glucosidase  26.79 
 
 
797 aa  253  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.109594 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0006  Alpha-glucosidase  28.63 
 
 
752 aa  253  1e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0171  Alpha-glucosidase  27.2 
 
 
777 aa  249  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2868  Alpha-glucosidase  31.23 
 
 
779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1660  glycoside hydrolase family protein  37.37 
 
 
784 aa  245  1.9999999999999999e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.624656  hitchhiker  0.00115127 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2333  alpha-glucosidase  27.75 
 
 
746 aa  244  6e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0803  a-glucosidase  27.84 
 
 
794 aa  240  8e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00272657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2746  Alpha-glucosidase  28.62 
 
 
799 aa  240  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.441472  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1870  Alpha-glucosidase  28.53 
 
 
798 aa  235  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.785633  normal  0.641991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2545  Alpha-glucosidase  30.29 
 
 
785 aa  231  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000167108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0983  glycosy hydrolase family protein  27.03 
 
 
836 aa  229  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3127  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 
813 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1692  Alpha-glucosidase  28.07 
 
 
743 aa  226  9e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.90141  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0046  glycoside hydrolase, family 31  29.09 
 
 
679 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.39622  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0046  glycoside hydrolase, family 31  29.09 
 
 
679 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.118014  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0044  glycoside hydrolase, family 31  29.09 
 
 
679 aa  225  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.228548  decreased coverage  0.00512205 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0045  glycoside hydrolase, family 31  29.09 
 
 
679 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0045  glycoside hydrolase, family 31  28.93 
 
 
679 aa  224  6e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.229343  normal  0.24021 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1081  glucosidase protein  29.66 
 
 
803 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00242883  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2338  Alpha-glucosidase  27.66 
 
 
839 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185932  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1013  glycoside hydrolase family 31  29.74 
 
 
803 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.36394  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0019  glycosy hydrolase family protein  28.62 
 
 
679 aa  216  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0278482  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3837  Alpha-glucosidase  29.11 
 
 
828 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452643  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0948  glycoside hydrolase family 31  29.01 
 
 
803 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0874171 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4015  Alpha-glucosidase  27.1 
 
 
845 aa  213  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03950  glycosyl hydrolase, family 31  26.32 
 
 
821 aa  213  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4047  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 
806 aa  209  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.175314 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4208  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 
806 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0739255  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4158  glycoside hydrolase family protein  29.76 
 
 
806 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00315991 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3358  Alpha-glucosidase  29.76 
 
 
806 aa  207  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.032039  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1872  Alpha-glucosidase  29.66 
 
 
806 aa  207  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00900175  normal  0.24419 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3565  Alpha-glucosidase  30.2 
 
 
806 aa  207  6e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443283  normal  0.722523 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2608  glycoside hydrolase family 31  30.56 
 
 
695 aa  206  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805177  normal  0.759517 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0793  Alpha-glucosidase  25.25 
 
 
700 aa  203  7e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3324  Alpha-glucosidase  28.39 
 
 
825 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000336077 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1902  Alpha-glucosidase  26.23 
 
 
806 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000358831 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3217  Alpha-glucosidase  30.49 
 
 
821 aa  202  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_429  predicted protein  27.98 
 
 
815 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0318632  normal  0.136701 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3867  Alpha-glucosidase  27.33 
 
 
784 aa  201  5e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.191857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4229  alpha-glucosidase  27.87 
 
 
678 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>