More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2983 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 425 aa  864    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  57.39 
 
 		 433 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  51.85 
 
 		 444 aa  462  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  53.23 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  51.09 
 
 		 431 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01480  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  48.09 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  45.52 
 
 		 431 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4612  extracellular solute-binding protein family 1  38.82 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 470 aa  140  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 445 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 		 452 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00840  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 451 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0072  sugar ABC transporter periplasmic protein  54.55 
 
 		 99 aa  98.2  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  29.54 
 
 		 434 aa  93.6  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  26.39 
 
 		 433 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 451 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1490  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  24.52 
 
 		 442 aa  89  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.095095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26.4 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  23.66 
 
 		 464 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 441 aa  87.4  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  30.05 
 
 		 435 aa  84  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3365  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.079846  hitchhiker  0.00220666 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.7 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4889  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  28.2 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3534  extracellular solute-binding protein family 1  25.17 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.582574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 466 aa  79.3  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.11 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  23.99 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 419 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  26.84 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  32.24 
 
 		 495 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 420 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  22.45 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7707  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.28 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 419 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.47 
 
 		 403 aa  72.8  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 431 aa  72.8  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  28.5 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2999  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.662901  hitchhiker  0.0000395876 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1492  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  21.35 
 
 		 441 aa  72  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.65 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.23 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  31.61 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  23.19 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  23.57 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  26.05 
 
 		 435 aa  70.9  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  31.79 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.49 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.15 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  22.3 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  24.27 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0573  extracellular solute-binding protein  27.92 
 
 		 460 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.77 
 
 		 413 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.1 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  27.3 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  26.5 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  23.92 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1792  extracellular solute-binding protein  24.84 
 
 		 462 aa  65.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  26.91 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.74 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  27.85 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  22.46 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  23.1 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0659  extracellular solute-binding protein family 1  35.2 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.579585  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1939  putative sugar ABC transporter binding protein subunit  34.07 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  27.31 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  34.19 
 
 		 424 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  24.32 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  30.67 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  24.64 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22980  putative binding protein component of ABC sugar transporter  33.52 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.16871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3246  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00178427  normal  0.716937 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  23.7 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1055  extracellular solute-binding protein  26.61 
 
 		 418 aa  62.4  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.404897  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 		 423 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  22.6 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2582  extracellular solute-binding protein family 1  23.81 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2297  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>