More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2977 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  45.93 
 
 		 193 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  41.9 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  40.45 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 209 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  43.03 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.87 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2546  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 207 aa  108  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  36.08 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 200 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 215 aa  104  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02720  transcriptional regulator, tetR family  35.03 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.460979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  36.32 
 
 		 221 aa  101  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 222 aa  101  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 209 aa  101  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2619  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  35.87 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 210 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6256  Transcriptional regulator  31.12 
 
 		 219 aa  91.3  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.109242  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  30.88 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 195 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 224 aa  89.4  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 218 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  30.89 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5005  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.143864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1944  AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  81.3  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1940  AcrR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.682868  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4786  transcriptional regulator, TetR family  35.22 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.187473  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2338  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.857275  normal  0.161469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  33.57 
 
 		 346 aa  74.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34550  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00167706  normal  0.63182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.94 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  56.6 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  31.41 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3120  hypothetical protein  36.67 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 220 aa  62  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 291 aa  58.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.68 
 
 		 227 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>