More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2920 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  870    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  58.74 
 
 		 426 aa  497  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  58.27 
 
 		 427 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  36.94 
 
 		 434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 424 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  32.43 
 
 		 424 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  32.44 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  34.02 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0529  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 464 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.361956  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.5 
 
 		 426 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  28.99 
 
 		 427 aa  103  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  27.87 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.1 
 
 		 431 aa  87.4  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  26.79 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  27 
 
 		 430 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  23.35 
 
 		 431 aa  83.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1392  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000859872  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 		 483 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  26.95 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  33.18 
 
 		 441 aa  81.3  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  25.28 
 
 		 488 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 420 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  25.63 
 
 		 488 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.12 
 
 		 449 aa  77.8  0.0000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  24.78 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  22.56 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  33.19 
 
 		 429 aa  76.3  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  24.53 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  24.87 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  27.95 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  24.73 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0780  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  23.97 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  34.38 
 
 		 418 aa  73.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2417  transcriptional regulator, ABC transporter  30.37 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0335393 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 425 aa  71.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2537  extracellular solute-binding protein family 1  32.12 
 
 		 450 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.272028  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23.88 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.8 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  36 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 430 aa  68.9  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  23.93 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 		 488 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  24.18 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3329  extracellular solute-binding protein  27.39 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0332045  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 		 443 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2553  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.964139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.99 
 
 		 458 aa  67.4  0.0000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0403  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.512139  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  27.57 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  22.22 
 
 		 415 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0322  extracellular solute-binding protein family 1  25.93 
 
 		 445 aa  66.6  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 410 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  23.52 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  26.13 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.56 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.85 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0499  extracellular solute-binding protein family 1  30.41 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000057577 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  24.17 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  26.45 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  28.37 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5409  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  31 
 
 		 457 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  24.73 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3027  extracellular solute-binding protein  21.35 
 
 		 467 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05230  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.61 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.808581  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  25.44 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  24.45 
 
 		 416 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2041  extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 436 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3131  extracellular solute-binding protein family 1  29.13 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00803878 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  24.42 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  24.71 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0192  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.63 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.03 
 
 		 431 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  23.65 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 433 aa  62  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4468  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 495 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.41 
 
 		 438 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  23.63 
 
 		 408 aa  62  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1941  sugar ABC transporter, sugar-binding protein, putative  27.54 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  28.49 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>