More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2782 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2782  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 294 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1621  transcriptional regulator, MarR family  51.56 
 
 		 327 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00140821  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1740  LysR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0545937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1853  transcriptional regulator, LysR family  51.81 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0656  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0029  LysR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 305 aa  142  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3489  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.256692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3552  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.191532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3502  LysR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5881  transcriptional regulator, LysR family  40.8 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0595  transcriptional regulator, LysR family  38.35 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0569  transcriptional regulator, LysR family  38.43 
 
 		 324 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5125  LysR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 296 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932924  normal  0.723753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1988  transcriptional regulator, LysR family  35.49 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.994481 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4433  transcriptional regulator, LysR family  39.37 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2018  LysR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0853412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3940  transcriptional regulator, LysR family  37.86 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1104  transcriptional regulator, LysR family  37.65 
 
 		 298 aa  125  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02220  transcriptional regulator  38.87 
 
 		 304 aa  125  9e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7065  transcriptional regulator, LysR family  41.45 
 
 		 294 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2225  transcriptional regulator, LysR family  38.74 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00118451  normal  0.339624 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0043  transcriptional regulator, LysR family  38.93 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2098  LysR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0305237  normal  0.157419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7868  transcriptional regulator, LysR family  37.81 
 
 		 296 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.365024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6150  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0301422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2134  transcriptional regulator, LysR family  36.86 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.272007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3338  transcriptional regulator, LysR family  32.14 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0267  LysR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 300 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.334674  normal  0.614052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0540  transcriptional regulator, LysR family  36.69 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15621  normal  0.23196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2545  transcriptional regulator, LysR family  35.06 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.57327  normal  0.794961 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2648  transcriptional regulator, LysR family  38.37 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2292  transcriptional regulator, LysR family  35.98 
 
 		 315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.863525  normal  0.0374167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1321  transcriptional regulator, LysR family  34.41 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.105252  normal  0.107974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0815  LysR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0655  transcriptional regulator, LysR family  33.6 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6287  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 304 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6763  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 303 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2254  LysR family transcriptional regulator  36 
 
 		 314 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17270  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00802596  hitchhiker  0.00407131 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4400  transcriptional regulator, LysR family  37.19 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103907  hitchhiker  0.00279425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4424  LysR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3675  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2386  transcriptional regulator, LysR family  38 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00159604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4076  transcriptional regulator, LysR family  34.91 
 
 		 331 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2822  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.438739  normal  0.714096 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6247  transcriptional regulator, LysR family  35.52 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.967227  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6522  transcriptional regulator, LysR family  37.65 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3886  LysR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 311 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3118  transcriptional regulator, LysR family  34.01 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181053  normal  0.0120636 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2508  LysR substrate-binding protein  32.78 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1455  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1783  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01316  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.789583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01326  hypothetical protein  27.03 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1986  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.388332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2286  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1553  putative DNA-binding transcriptional regulator  27.03 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381755  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5919  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 332 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0217311  normal  0.163471 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2446  transcriptional regulator, LysR family  36.63 
 
 		 308 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2305  transcriptional regulator, LysR family  27.03 
 
 		 302 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.661434  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1582  putative DNA-binding transcriptional regulator  26.69 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19590  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 311 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.221792  normal  0.0758544 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1796  transcriptional regulator, LysR family  33.99 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2582  LysR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1625  transcriptional regulator, LysR family  29.2 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6793  transcriptional regulator, LysR family  31.85 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5552  putative transcriptional regulator protein, LysR family  34.24 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.409042 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4856  LysR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0305285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1552  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 297 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22480  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.542371 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1667  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.1728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4403  LysR substrate-binding protein  33.86 
 
 		 303 aa  103  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.900242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1422  LysR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00195938  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1625  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0991587  normal  0.570552 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1603  LysR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 297 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36460  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 304 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.776376  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4368  LysR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000508648  normal  0.184507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4593  LysR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1216  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.607873  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1695  LysR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 297 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2223  transcriptional regulator, LysR family  30.12 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1507  transcriptional regulator, LysR family  33.87 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.352143 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4645  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0270127  normal  0.686665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9290  LysR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 311 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00330  transcriptional regulator  33.47 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.531846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0716  transcriptional regulator, LysR family  35.51 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.711839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4044  transcriptional regulator, LysR family  35.66 
 
 		 307 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180327  normal  0.114171 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1366  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2363  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0704968  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1384  LysR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 303 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.510026  normal  0.961764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2567  LysR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 338 aa  99.8  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259086  normal  0.599662 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4506  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.964558  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3732  transcriptional regulator, LysR family  26.64 
 
 		 300 aa  99.8  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000560912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0748  LysR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4546  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2031  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 333 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0205829  hitchhiker  0.00632018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6024  transcriptional regulator, LysR family  30.49 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2123  transcriptional regulator, LysR family  33.86 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000012035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1355  LysR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0582  transcriptional regulator, LysR family  35.29 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>