More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2779 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  52.25 
 
 		 181 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  47.78 
 
 		 187 aa  160  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  48.6 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 197 aa  150  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  46.01 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 204 aa  132  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  44.71 
 
 		 203 aa  124  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 178 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  34.09 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  34.09 
 
 		 178 aa  117  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  38.79 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  42.44 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  36.26 
 
 		 193 aa  99  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  32.08 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.57 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  33.89 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 428 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 184 aa  65.1  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6786  TetR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4264  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1944  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0973  regulatory protein, TetR  31.61 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.995108  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6787  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  33.11 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6034  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.93 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 228 aa  54.7  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 415 aa  54.7  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  54.3  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 238 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  35.64 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 222 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 233 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2619  HTH-type luminescence regulator LitR  28.72 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2679  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31350  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112877  normal  0.357558 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3434  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3847  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.252303  normal  0.0620213 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 172 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1092  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0623718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1836  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0359893  normal  0.350648 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 414 aa  52  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4097  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  38.81 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 211 aa  52  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>