More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2695 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  60.14 
 
 		 7210 aa  7422    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  53.34 
 
 		 3494 aa  3007    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2882  Beta-ketoacyl synthase  34.99 
 
 		 2462 aa  660    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.17345 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2734  Erythronolide synthase., Oleoyl-(acyl-carrier-protein) hydrolase  41.55 
 
 		 1337 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  36.59 
 
 		 1827 aa  777    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  60.45 
 
 		 1584 aa  999    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10410  membrane bound polyketide synthase pks6  42.3 
 
 		 1402 aa  691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  51.39 
 
 		 2024 aa  845    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.89 
 
 		 3092 aa  1231    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  51.5 
 
 		 3463 aa  2845    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  45.6 
 
 		 2719 aa  1117    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  44.91 
 
 		 2066 aa  1225    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  51.24 
 
 		 7279 aa  3735    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51.03 
 
 		 3711 aa  2846    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  48.87 
 
 		 3493 aa  1442    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  53.01 
 
 		 2376 aa  902    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  50.98 
 
 		 3158 aa  1324    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1963  Beta-ketoacyl synthase  40.43 
 
 		 2880 aa  785    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.354104 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3359  Acyl transferase  38.47 
 
 		 2220 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.23 
 
 		 2551 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.26 
 
 		 1874 aa  959    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  41.81 
 
 		 1656 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  45.41 
 
 		 3148 aa  1358    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  44.04 
 
 		 1587 aa  717    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  55.32 
 
 		 3254 aa  1219    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.64 
 
 		 3101 aa  650    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  46.55 
 
 		 3400 aa  749    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  45.83 
 
 		 4930 aa  2758    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0170  Beta-ketoacyl synthase  35.89 
 
 		 3645 aa  1543    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  46.16 
 
 		 4840 aa  1744    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1609  amino acid adenylation  39.05 
 
 		 3252 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.48 
 
 		 5400 aa  4388    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 		 3874 aa  1738    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  40.08 
 
 		 2232 aa  760    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  48.91 
 
 		 2847 aa  1324    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  51.49 
 
 		 2081 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  31.56 
 
 		 3111 aa  738    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  36.49 
 
 		 2333 aa  727    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5779  Beta-ketoacyl synthase  41.77 
 
 		 2047 aa  658    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  49.77 
 
 		 5154 aa  2372    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  54.46 
 
 		 2126 aa  1260    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  62.67 
 
 		 1601 aa  1029    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.1 
 
 		 3693 aa  914    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  50.11 
 
 		 2107 aa  1299    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  48.18 
 
 		 4575 aa  1427    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  38.22 
 
 		 2762 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  39.05 
 
 		 2085 aa  663    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  34.04 
 
 		 1704 aa  648    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  52.21 
 
 		 4151 aa  1500    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  33.41 
 
 		 2551 aa  710    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 		 1816 aa  1637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  41.13 
 
 		 1354 aa  694    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  57.11 
 
 		 3408 aa  2500    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  40.95 
 
 		 2230 aa  746    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  50.71 
 
 		 1602 aa  1137    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  53.92 
 
 		 1789 aa  1534    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  55.98 
 
 		 1071 aa  866    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  53.42 
 
 		 6768 aa  1503    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  40.33 
 
 		 4478 aa  828    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  41.18 
 
 		 1087 aa  709    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  33.61 
 
 		 1876 aa  696    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.1 
 
 		 3693 aa  914    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  55.95 
 
 		 2966 aa  2027    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 7110 aa  13760    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3023  Erythronolide synthase  36.26 
 
 		 1349 aa  679    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  39.05 
 
 		 2085 aa  663    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  34.04 
 
 		 1704 aa  648    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.65 
 
 		 3676 aa  894    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1000  amino acid adenylation domain-containing protein  45.64 
 
 		 2477 aa  660    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 		 3696 aa  835    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  57.17 
 
 		 1593 aa  866    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  35.31 
 
 		 1805 aa  776    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  49.54 
 
 		 4607 aa  1066    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  54.71 
 
 		 2374 aa  931    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  33.25 
 
 		 1828 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3022  Beta-ketoacyl synthase  41.25 
 
 		 1559 aa  676    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1010  KR domain-containing protein  35.94 
 
 		 2604 aa  647    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  53.11 
 
 		 2367 aa  1221    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  42.5 
 
 		 3176 aa  853    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.31 
 
 		 3033 aa  1022    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  57.85 
 
 		 1548 aa  913    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  52.21 
 
 		 1831 aa  1488    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.17 
 
 		 1832 aa  796    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  56.22 
 
 		 1143 aa  897    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  48.26 
 
 		 3508 aa  2752    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  39.98 
 
 		 3702 aa  894    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  57.14 
 
 		 3355 aa  2023    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  33.05 
 
 		 1939 aa  875    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  39.05 
 
 		 2085 aa  663    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  52.93 
 
 		 4080 aa  2419    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  53.94 
 
 		 1955 aa  922    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  51.88 
 
 		 5255 aa  4336    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  48.42 
 
 		 2060 aa  996    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  37.96 
 
 		 3679 aa  906    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  49.85 
 
 		 3670 aa  1589    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  33.02 
 
 		 1835 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  39.77 
 
 		 1806 aa  642    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  49.52 
 
 		 2113 aa  1314    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  49.3 
 
 		 1924 aa  1297    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  48.92 
 
 		 2090 aa  1355    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>