More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2685 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2685  proline-specific peptidase  100 
 
 
296 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.492833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2777  proline-specific peptidase  65.2 
 
 
306 aa  389  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.159674  decreased coverage  0.000853285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2123  Prolyl aminopeptidase  56.7 
 
 
300 aa  321  9.000000000000001e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2180  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  55.56 
 
 
299 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5637  hydrolases or acyltransferases (alpha/beta hydrolase superfamily)  50.68 
 
 
297 aa  305  4.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0678785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4540  proline iminopeptidase, putative  52.36 
 
 
316 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.999347  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6377  proline-specific peptidase  50.18 
 
 
300 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.843826  normal  0.494551 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4217  peptidase S33, tricorn interacting factor 1  47.77 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.7959 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6197  proline-specific peptidase  49.47 
 
 
300 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.941686 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02210  proline imino-peptidase  51.37 
 
 
313 aa  278  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.100587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0552  proline-specific peptidase  50.86 
 
 
319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.698473 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1477  proline iminopeptidase like protein  36.62 
 
 
297 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.140845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10858  proline iminopeptidase pip  36.33 
 
 
286 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000563068 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6195  proline-specific peptidase  39.77 
 
 
296 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.816289 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6375  proline-specific peptidase  39.77 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.713939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5407  proline-specific peptidase  40.14 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.348936 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0858  proline-specific peptidase  35 
 
 
303 aa  167  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1914  proline-specific peptidase  37.94 
 
 
305 aa  166  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.094773 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2163  proline-specific peptidase  32.84 
 
 
295 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2521  proline-specific peptidase  35.58 
 
 
292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11350  proline-specific peptidase  31.46 
 
 
295 aa  146  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16440  proline-specific peptidase  28.76 
 
 
298 aa  141  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.700734 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24200  proline-specific peptidase  29.54 
 
 
316 aa  135  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3362  proline-specific peptidase  29.53 
 
 
346 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.158182 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21290  proline-specific peptidase  29 
 
 
298 aa  132  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1984  proline-specific peptidase  28.62 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3901  proline-specific peptidase  30.61 
 
 
369 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0490645 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1849  prolyl aminopeptidase  27.51 
 
 
304 aa  129  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000467937  hitchhiker  0.000191217 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1648  proline-specific peptidase  31.62 
 
 
303 aa  124  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0035  proline-specific peptidase  32.34 
 
 
320 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0847997  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2662  proline-specific peptidase  29.59 
 
 
323 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000838232  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0052  prolyl aminopeptidase  29.07 
 
 
304 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.946601  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0241  alpha/beta fold family hydrolase  28.67 
 
 
292 aa  105  7e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.313892  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0261  proline-specific peptidase  26.62 
 
 
348 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0576  tricorn interacting factor F1  28.52 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0830  proline-specific peptidase  26.87 
 
 
301 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.269781  unclonable  0.00000881628 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  27.21 
 
 
286 aa  85.9  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2561  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0975578  normal  0.452958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0937  prolyl aminopeptidase  27.54 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4484  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48133  predicted protein  24.64 
 
 
360 aa  73.9  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0537901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
288 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  31.43 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40124  predicted protein  26.54 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.277877  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
299 aa  68.9  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  30.07 
 
 
261 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  24.57 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  26.5 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5500  putative prolyl aminopeptidase  26.71 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0980519  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2251  Alpha/beta hydrolase fold-1  25.19 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1173  proline iminopeptidase, putative  24.32 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 
282 aa  66.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5097  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  27 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4148  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0778335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2000  proline iminopeptidase  24.39 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118293  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
288 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2199  hydrolase, alpha/beta fold family  24.74 
 
 
291 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3126  hydrolase, alpha/beta fold family  24.05 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.83373  normal  0.0124269 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.67 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.67 
 
 
260 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16031  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  24.26 
 
 
323 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4144  alpha/beta hydrolase fold protein  27.13 
 
 
269 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2245  hydrolase, alpha/beta fold family  23.78 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1528899999999994e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2061  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2217  alpha/beta fold family hydrolase  24.04 
 
 
303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.716655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
267 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
280 aa  63.5  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
265 aa  63.5  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0763  alpha/beta fold family hydrolase  24.6 
 
 
323 aa  63.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3216  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
281 aa  63.5  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13885  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.72 
 
 
387 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1382  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.327578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0891  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
271 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.020907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.43 
 
 
271 aa  62.8  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1695  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
284 aa  62.4  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.194275  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2001  proline iminopeptidase  23.69 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000475333  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0592  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
294 aa  61.6  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2247  alpha/beta fold family hydrolase  23.18 
 
 
291 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371226  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.45 
 
 
273 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1622  alpha/beta hydrolase fold  24.81 
 
 
284 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2370  proline iminopeptidase  24.48 
 
 
296 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.17 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  24.37 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37110  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.23 
 
 
268 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
277 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  26.82 
 
 
363 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2962  proline iminopeptidase  23.69 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.305011  normal  0.0401306 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
266 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 
387 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  22.22 
 
 
253 aa  60.8  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 
263 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>