More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2683 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2684  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.15 
 
 		 5400 aa  799    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2779  acyl transferase domain-containing protein  59.71 
 
 		 1584 aa  1676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0386346  normal  0.0852207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3473  Beta-ketoacyl synthase  48.97 
 
 		 4840 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0216506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3476  6-deoxyerythronolide-B synthase  45.44 
 
 		 2078 aa  650    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.975102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4443  Acyl transferase  45.93 
 
 		 2847 aa  645    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  44.14 
 
 		 3158 aa  1047    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  51 
 
 		 3711 aa  764    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  53.86 
 
 		 4151 aa  880    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4698  thioester reductase domain protein  51.41 
 
 		 2113 aa  775    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4442  Acyl transferase  56.25 
 
 		 3670 aa  866    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3180  Acyl transferase  54.54 
 
 		 3355 aa  842    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  59.18 
 
 		 7210 aa  960    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  50.39 
 
 		 2719 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4687  coronafacic acid polyketide synthetase II  43.89 
 
 		 2066 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4133  6-deoxyerythronolide-B synthase  53.91 
 
 		 1305 aa  894    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.337953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  51.81 
 
 		 3463 aa  805    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0495  6-deoxyerythronolide-B synthase  46.11 
 
 		 1126 aa  673    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.764757  normal  0.272973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4699  Mycocerosate synthase., Erythronolide synthase  52.22 
 
 		 4080 aa  780    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  47.34 
 
 		 3493 aa  1158    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3985  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.57 
 
 		 2551 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4134  6-deoxyerythronolide-B synthase  48.78 
 
 		 1101 aa  768    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3471  erythronolide synthase  50.16 
 
 		 1071 aa  703    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0801482  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3152  Beta-ketoacyl synthase  45.58 
 
 		 1548 aa  1068    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0379641  normal  0.36258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  54.28 
 
 		 4607 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11680  polyketide synthase pks8  52.92 
 
 		 1602 aa  801    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.231652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2681  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.42 
 
 		 1816 aa  791    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.909004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3151  Beta-ketoacyl synthase  51.26 
 
 		 2367 aa  746    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.930578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  55.58 
 
 		 4575 aa  802    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  55.46 
 
 		 3494 aa  866    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  42.75 
 
 		 2230 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  54.56 
 
 		 3508 aa  890    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3056  thioester reductase domain-containing protein  47.21 
 
 		 2376 aa  693    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0594537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3888  Beta-ketoacyl synthase  46.39 
 
 		 3254 aa  1131    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2981  beta-ketoacyl synthase  41.26 
 
 		 2081 aa  981    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.365898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4440  thioester reductase domain protein  50.32 
 
 		 2107 aa  708    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.89 
 
 		 3092 aa  1471    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  49.95 
 
 		 1114 aa  890    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  53.49 
 
 		 5255 aa  883    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  47.26 
 
 		 3449 aa  1185    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.6 
 
 		 7110 aa  1041    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  38.2 
 
 		 3693 aa  839    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  52.86 
 
 		 3930 aa  868    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2833  beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 		 1520 aa  690    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139405  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  54.3 
 
 		 2277 aa  871    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4135  Acyl transferase  54.28 
 
 		 2108 aa  914    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  41.87 
 
 		 2225 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3477  Acyl transferase  42.73 
 
 		 3281 aa  955    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3198  Acyl transferase  51.63 
 
 		 3148 aa  690    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3479  Acyl transferase  49.24 
 
 		 1077 aa  743    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  54.14 
 
 		 6768 aa  1384    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  52.58 
 
 		 1867 aa  880    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  56.22 
 
 		 1789 aa  905    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3086  Beta-ketoacyl synthase  42.62 
 
 		 1955 aa  979    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3472  Beta-ketoacyl synthase  49.01 
 
 		 4111 aa  827    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0447934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  57.54 
 
 		 3874 aa  903    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3480  Mycocerosate synthase., 6-deoxyerythronolide-B synthase  47.21 
 
 		 4264 aa  685    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3179  Acyl transferase  52.29 
 
 		 1593 aa  1249    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.821587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2780  beta-ketoacyl synthase  50.16 
 
 		 3033 aa  1231    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.564666 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  38.2 
 
 		 3693 aa  839    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  51.95 
 
 		 2090 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2877  beta-ketoacyl synthase  35.1 
 
 		 1520 aa  690    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.808435  normal  0.117194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2969  Acyl transferase  36.16 
 
 		 3427 aa  662    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00814021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  52.93 
 
 		 2846 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3478  Acyl transferase  42.72 
 
 		 1573 aa  905    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  37.84 
 
 		 3676 aa  813    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2957  amino acid adenylation domain protein  46.33 
 
 		 4882 aa  684    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.221364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  37.62 
 
 		 3696 aa  822    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 		 1837 aa  690    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185251  normal  0.018341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  36.54 
 
 		 1581 aa  673    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  44.75 
 
 		 4183 aa  664    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4837  Beta-ketoacyl synthase  50.21 
 
 		 1924 aa  761    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0223508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4268  erythronolide synthase  41.24 
 
 		 2024 aa  910    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.35732 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3154  Beta-ketoacyl synthase  48.3 
 
 		 2060 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0861299 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  57.4 
 
 		 3408 aa  969    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  30.84 
 
 		 2762 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3156  Beta-ketoacyl synthase  46.28 
 
 		 7279 aa  1050    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0951924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  43.37 
 
 		 2232 aa  671    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  49.9 
 
 		 5154 aa  1226    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  54.66 
 
 		 2126 aa  913    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  49.11 
 
 		 2374 aa  702    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  38.52 
 
 		 3702 aa  840    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12946  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsB  34.58 
 
 		 1537 aa  697    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  51.58 
 
 		 2020 aa  793    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  56.93 
 
 		 2966 aa  930    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  40.5 
 
 		 3400 aa  669    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  56.39 
 
 		 1831 aa  887    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7002  Acyl transferase  52.11 
 
 		 1820 aa  855    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.132445 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2683  Acyl transferase  100 
 
 		 1601 aa  3111    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  38.05 
 
 		 3679 aa  783    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4838  Beta-ketoacyl synthase  51.94 
 
 		 4930 aa  781    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.15888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4836  erythronolide synthase  51.95 
 
 		 1143 aa  823    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0120543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  37.55 
 
 		 1144 aa  634  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3392  acyl transferase domain-containing protein  43.89 
 
 		 1822 aa  631  1e-179  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572453  normal  0.26547 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3125  beta-ketoacyl synthase  43.53 
 
 		 1812 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  43.89 
 
 		 2890 aa  630  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  44.97 
 
 		 1909 aa  624  1e-177  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  39.07 
 
 		 1939 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3822  beta-ketoacyl synthase  36.93 
 
 		 1354 aa  618  1e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  41.87 
 
 		 1805 aa  618  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  36.9 
 
 		 1587 aa  614  9.999999999999999e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>