60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2652 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  41.33 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  36.84 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  37.82 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.18 
 
 		 206 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.61 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  35.87 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  36.12 
 
 		 227 aa  108  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.88 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.82 
 
 		 204 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  34.7 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.67 
 
 		 208 aa  104  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  38.46 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.17 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.42 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  33.04 
 
 		 210 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  32.08 
 
 		 229 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.88 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  36.79 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.41 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  32.63 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  32.41 
 
 		 275 aa  85.1  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.04 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  25.34 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1588  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.49 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3319  CRISPR-associated Cse3 family protein  31.16 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.148514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.53 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1809  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.7 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3093  crispr-associated protein, Cse3 family  35.19 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3149  crispr-associated protein Cse3 family  35.19 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.62558 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0231  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.08 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.51 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.26 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2988  CRISPR-associated Cse3 family protein  32.95 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.56 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.63 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1376  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.51 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00399966  normal  0.582034 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.19 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.19 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5410  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.37 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341034  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3250  crispr-associated protein, Cse3 family  24.51 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2884  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.98 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.542217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  23.19 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  25.49 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1603  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.03 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.61218  normal  0.84733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3133  Cse3 family CRISPR-associated protein  24.02 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3118  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.12 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1389  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.65 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.831554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4009  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.49 
 
 		 216 aa  52  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  27.36 
 
 		 180 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.14 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.44 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3586  CRISPR-associated protein, Cse3 family  31.43 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0961  hypothetical protein  33.33 
 
 		 299 aa  48.5  0.00009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00870  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.4 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0423  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.87 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0256253  normal  0.0209563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.85 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0170  CRISPR-associated Cse3 family protein  41.67 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.396726  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  36.96 
 
 		 215 aa  42.4  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>