27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2561 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2561  hypothetical protein  100 
 
 
867 aa  1607    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00089878  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1245  hypothetical protein  32.05 
 
 
820 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.162309999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4154  hypothetical protein  40.04 
 
 
643 aa  227  7e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0191  Sel1 domain protein repeat-containing protein  25.89 
 
 
1344 aa  227  9e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2859  hypothetical protein  29.47 
 
 
866 aa  200  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0638681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4431  hypothetical protein  33.4 
 
 
954 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28820  hypothetical protein  31.35 
 
 
832 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778693  decreased coverage  0.00000000161145 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3424  hypothetical protein  30.53 
 
 
828 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.827282  normal  0.753977 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1947  hypothetical protein  30.25 
 
 
777 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231119  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1836  hypothetical protein  31.38 
 
 
798 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2290  hypothetical protein  31.87 
 
 
798 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.947469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5143  hypothetical protein  32.18 
 
 
798 aa  156  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.09812 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4980  hypothetical protein  29.05 
 
 
1123 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2541  hypothetical protein  26.33 
 
 
750 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1169  hypothetical protein  26.85 
 
 
782 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0139  hypothetical protein  27.47 
 
 
812 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0221  plasma membrane H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  27.94 
 
 
845 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.927678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2000  hypothetical protein  30.67 
 
 
797 aa  127  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8550  hypothetical protein  33.17 
 
 
728 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128819  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5416  hypothetical protein  26.36 
 
 
747 aa  105  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0063  hypothetical protein  32.02 
 
 
1356 aa  88.6  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.80787  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0328  hypothetical protein  28.34 
 
 
726 aa  86.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1078  hypothetical protein  26.77 
 
 
735 aa  79.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0495245  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  34.04 
 
 
3521 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  33.33 
 
 
3472 aa  65.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  33.33 
 
 
3471 aa  64.7  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  32.19 
 
 
3409 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>