58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2534 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2534  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 404 aa  793    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.478006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0402  extracellular solute-binding protein family 1  42.34 
 
 		 447 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  29.41 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14550  extracellular solute-binding protein family 1  30.7 
 
 		 432 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000299418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0355  extracellular solute-binding protein family 1  30.71 
 
 		 453 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.179225 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4345  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 450 aa  166  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.216447 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1946  extracellular solute-binding protein  33.25 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0387  extracellular solute-binding protein family 1  30.3 
 
 		 453 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2855  extracellular solute-binding protein  30.08 
 
 		 451 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2910  ABC alpha-glucoside transporter extracellular solute-binding protein, family 1  29.56 
 
 		 452 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.320115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1180  extracellular solute-binding protein  30.87 
 
 		 485 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1147  extracellular solute-binding protein  33.16 
 
 		 544 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3716  extracellular solute-binding protein family 1  30.48 
 
 		 440 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3307  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 		 449 aa  159  9e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  0.775669 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0292  extracellular solute-binding protein  32.26 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2873  ABC alpha-glucoside transporter, perplasmic substrate-binding protein  32.03 
 
 		 450 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.182804  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1519  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 		 450 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.846969  normal  0.200847 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0785  ABC transporter substrate binding protein (alpha-glucoside)  31.05 
 
 		 452 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2325  extracellular solute-binding protein family 1  33.16 
 
 		 444 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0032194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1652  putative solute-binding protein 1 family  29.53 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182094  hitchhiker  0.00000465499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26130  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.06 
 
 		 448 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0719829  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0869  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.293785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2337  ABC-type glucosylglycerol transport system substrate-binding protein  27.44 
 
 		 448 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.176838  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2626  extracellular solute-binding protein family 1  30.02 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0491272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7166  alpha-glucoside ABC transporter  27.54 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0136035 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  29.44 
 
 		 466 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2936  extracellular solute-binding protein family 1  29.25 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.322365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3587  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.69287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1625  alpha-glucoside ABC transporter periplasmic- binding protein  28.45 
 
 		 442 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.234885  normal  0.190993 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3914  extracellular solute-binding protein  28.61 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3967  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 448 aa  116  8.999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182057  normal  0.154584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5758  extracellular solute-binding protein family 1  28.33 
 
 		 498 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.576382  normal  0.192043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3182  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 464 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.145583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3237  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0267  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39283  normal  0.349323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4648  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000260895 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01750  carbohydrate-binding protein  25.45 
 
 		 457 aa  94.4  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110954  normal  0.899537 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5152  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 482 aa  93.2  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  27.86 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.87 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3469  extracellular solute-binding protein family 1  22.18 
 
 		 446 aa  53.1  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  24.21 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26610  carbohydrate-binding protein  26.6 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1303  extracellular solute-binding protein  24.74 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313179  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4906  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.507884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  25.12 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  23.37 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  22.61 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1001  extracellular solute-binding protein family 1  22.53 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.628257  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1588  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 452 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.04 
 
 		 432 aa  47  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  26.09 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3379  extracellular solute-binding protein  22.78 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  21.54 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2234  extracellular solute-binding protein family 1  23.46 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2094  extracellular solute-binding protein family 1  29.63 
 
 		 441 aa  43.9  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000152964 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3264  extracellular solute-binding protein  25.7 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.591163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>