202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2442 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  100 
 
 
267 aa  530  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  61.25 
 
 
280 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  58.56 
 
 
289 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  55.76 
 
 
277 aa  280  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  53.51 
 
 
277 aa  275  6e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  54.15 
 
 
297 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  56.13 
 
 
283 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  52.79 
 
 
281 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  50.55 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  50.4 
 
 
267 aa  238  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  50.76 
 
 
279 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  49.08 
 
 
277 aa  236  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  53.16 
 
 
280 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  51.09 
 
 
283 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  51.29 
 
 
273 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  48.03 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0773  siderophore-interacting protein  51.32 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.71701  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08230  siderophore-interacting protein  46.55 
 
 
282 aa  208  7e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.227116  normal  0.630679 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  46.13 
 
 
274 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  45.76 
 
 
281 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  44.77 
 
 
281 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  43.01 
 
 
285 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  43.01 
 
 
285 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  43.12 
 
 
285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3647  siderophore-interacting protein  44.81 
 
 
273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  45.79 
 
 
258 aa  174  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17630  siderophore-interacting protein  42.16 
 
 
285 aa  168  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.868687  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.14 
 
 
267 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12909  mycobactin utilization protein viuB  43.77 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000043443  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02400  siderophore-interacting protein  46.64 
 
 
292 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  40.07 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5386  Siderophore-interacting protein  43.18 
 
 
251 aa  155  9e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0562315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  42.46 
 
 
259 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  41.37 
 
 
247 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  39.41 
 
 
284 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  39.69 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  40.08 
 
 
272 aa  137  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  37.11 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.74 
 
 
281 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  36.68 
 
 
281 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  32.69 
 
 
257 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.74 
 
 
266 aa  128  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  37.91 
 
 
340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39.84 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1802  vibriobactin utilization protein ViuB  38.74 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20830  siderophore-interacting protein  41.53 
 
 
288 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.93855  normal  0.0153538 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  36.8 
 
 
255 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  40.79 
 
 
617 aa  123  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  36.11 
 
 
279 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  37.29 
 
 
312 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  35.29 
 
 
276 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  31.75 
 
 
272 aa  122  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  34.94 
 
 
255 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  31.01 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  36.48 
 
 
261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  37.55 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0118  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  36.26 
 
 
370 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  40.62 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 
250 aa  119  7e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  36.88 
 
 
304 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  29.59 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  42.93 
 
 
623 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.93 
 
 
299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  34.88 
 
 
265 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  40.7 
 
 
290 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 
250 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  31.13 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  37.5 
 
 
266 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  34.88 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  34.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  34.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  34.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  34.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  34.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  34.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  34.7 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  30.45 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.29 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.35 
 
 
247 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.57 
 
 
252 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.98 
 
 
253 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1860  iron-chelator utilization protein  36.65 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  32.84 
 
 
275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26750  siderophore-interacting protein  35.85 
 
 
296 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.27893  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  38.62 
 
 
348 aa  110  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  33.87 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.47 
 
 
253 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.34 
 
 
271 aa  107  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  35.8 
 
 
278 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  35.37 
 
 
361 aa  105  6e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.75 
 
 
273 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.56 
 
 
325 aa  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  34.36 
 
 
273 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  32.02 
 
 
275 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.18 
 
 
248 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.41 
 
 
283 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.18 
 
 
248 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.33 
 
 
308 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  34.8 
 
 
366 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.59 
 
 
273 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>