More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2435 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
253 aa  487  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  53.36 
 
 
254 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  42.75 
 
 
256 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  45.45 
 
 
258 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  44.8 
 
 
252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  42.31 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  45.04 
 
 
261 aa  177  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 
261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  42.75 
 
 
261 aa  168  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
261 aa  168  9e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  40.64 
 
 
278 aa  159  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  41.8 
 
 
258 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  42.75 
 
 
261 aa  158  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  38.7 
 
 
261 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
284 aa  149  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 
261 aa  145  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  38.04 
 
 
257 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
254 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  36.26 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  36.26 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  36.26 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  36.26 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  35.88 
 
 
257 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.2 
 
 
254 aa  133  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
254 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.35 
 
 
258 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  33.47 
 
 
259 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
253 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
260 aa  126  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  27.71 
 
 
254 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  41.04 
 
 
260 aa  125  5e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.94 
 
 
253 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  30.33 
 
 
253 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
251 aa  125  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  32.92 
 
 
259 aa  125  9e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  32.92 
 
 
257 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  32.92 
 
 
257 aa  124  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  32.92 
 
 
257 aa  124  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  34.72 
 
 
263 aa  124  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
257 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
274 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.86 
 
 
284 aa  123  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  31.75 
 
 
254 aa  123  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  34.77 
 
 
264 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  35.83 
 
 
253 aa  123  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
253 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
288 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.35 
 
 
250 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.77 
 
 
258 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
264 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  36 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  38.58 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  37.3 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  34.91 
 
 
251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  34.26 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.24 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.61 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  32.17 
 
 
251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.13 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5838  DeoR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
266 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 
290 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 
258 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  35.66 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  36.71 
 
 
248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.3 
 
 
251 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  36.61 
 
 
253 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
256 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  34.63 
 
 
264 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.3 
 
 
251 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  31.93 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  34.15 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 
269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  29.48 
 
 
269 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 
269 aa  109  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 
269 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 
269 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.48 
 
 
269 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  29.48 
 
 
269 aa  109  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6108  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
256 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 
266 aa  107  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>