91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2425 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  100 
 
 		 543 aa  1080    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  62.96 
 
 		 546 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  66.3 
 
 		 547 aa  739    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  57.4 
 
 		 534 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  54.82 
 
 		 533 aa  522  1e-147  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  39.34 
 
 		 534 aa  386  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  36.19 
 
 		 543 aa  229  7e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  35.83 
 
 		 544 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  34.43 
 
 		 530 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  34.94 
 
 		 513 aa  216  9e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  30.52 
 
 		 502 aa  210  5e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  35.63 
 
 		 538 aa  209  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  36.4 
 
 		 543 aa  207  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  33.27 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  28.01 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.05 
 
 		 786 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.98 
 
 		 557 aa  103  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.03 
 
 		 586 aa  101  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  29.51 
 
 		 563 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.7 
 
 		 623 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 591 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 591 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  25.79 
 
 		 591 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  26.32 
 
 		 622 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  27.79 
 
 		 540 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  25.74 
 
 		 552 aa  90.5  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  25.74 
 
 		 653 aa  90.1  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  25.74 
 
 		 632 aa  90.5  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  25.74 
 
 		 632 aa  90.5  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  26 
 
 		 632 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  26 
 
 		 632 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  26 
 
 		 632 aa  90.1  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.96 
 
 		 696 aa  89.7  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 		 657 aa  88.2  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  25.22 
 
 		 578 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.34 
 
 		 1150 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.47 
 
 		 556 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 889 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 577 aa  77.8  0.0000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1150 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.56 
 
 		 543 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  24.52 
 
 		 578 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.76 
 
 		 543 aa  76.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  30.88 
 
 		 564 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  25.27 
 
 		 578 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 		 547 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.29 
 
 		 569 aa  72.8  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.33 
 
 		 593 aa  72.4  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.54 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  24.25 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 563 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.78 
 
 		 582 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 583 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.68 
 
 		 572 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1152 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 		 1152 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 		 1132 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  50 
 
 		 738 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.41 
 
 		 562 aa  57  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 556 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 567 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  33.06 
 
 		 551 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.3 
 
 		 546 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.58 
 
 		 552 aa  53.9  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  24.63 
 
 		 489 aa  52  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 587 aa  51.6  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.56 
 
 		 550 aa  50.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.96 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.9 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  31.25 
 
 		 545 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 581 aa  49.3  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  20.49 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  43.55 
 
 		 577 aa  48.1  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.17 
 
 		 535 aa  47.8  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.04 
 
 		 562 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  35.79 
 
 		 541 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0648  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  21.16 
 
 		 546 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  36.36 
 
 		 521 aa  46.2  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  20.49 
 
 		 547 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.73 
 
 		 532 aa  45.8  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.14 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.21 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1428  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.53 
 
 		 544 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09011  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 617 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  44 
 
 		 697 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.23 
 
 		 565 aa  44.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  33.7 
 
 		 533 aa  44.3  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.33 
 
 		 657 aa  44.3  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  37.11 
 
 		 530 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3687  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.6 
 
 		 546 aa  43.9  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3534  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.24 
 
 		 950 aa  43.5  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.93778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>