More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2416 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2416  UspA domain protein  100 
 
 		 277 aa  537  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000209099  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  40.85 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  40.85 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  39.86 
 
 		 289 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  35.09 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4831  hypothetical protein  36.33 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.335515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  37.76 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22880  universal stress protein UspA-like protein  40.83 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.538505  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4822  UspA domain-containing protein  36.75 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1986  UspA domain protein  34.9 
 
 		 317 aa  118  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2043  UspA domain protein  36.59 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000173989  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3659  UspA domain-containing protein  35.09 
 
 		 293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.153996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12037  hypothetical protein  34.75 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3447  UspA domain-containing protein  37.24 
 
 		 296 aa  115  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728231  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.05 
 
 		 288 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  35.61 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1934  UspA domain protein  40.36 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3656  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 289 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0378694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0776  UspA domain protein  37.37 
 
 		 308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23130  universal stress protein UspA-like protein  40.14 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.688964  normal  0.113593 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1378  UspA domain-containing protein  36.62 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12642  hypothetical protein  34.86 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3626  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 293 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3475  UspA domain-containing protein  38.6 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3621  hypothetical protein  36.14 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.820337  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5277  UspA domain protein  36.49 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3694  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.34077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30750  universal stress protein UspA-like protein  34.47 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.537439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3526  hypothetical protein  35.84 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.369083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  34.63 
 
 		 294 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2042  UspA domain protein  33.45 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218244  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  33.92 
 
 		 293 aa  105  6e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  34.28 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  34.28 
 
 		 294 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3032  hypothetical protein  38.33 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3658  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0641627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0328  hypothetical protein  37.16 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0338  UspA domain-containing protein  37.16 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  37.55 
 
 		 289 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5439  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  38.57 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.132119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  35.02 
 
 		 287 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1800  UspA domain protein  34.51 
 
 		 347 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0593055  normal  0.0659308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0317  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1892  UspA domain-containing protein  38.38 
 
 		 294 aa  99.8  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281928  hitchhiker  0.00296839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0384  UspA domain protein  34.17 
 
 		 301 aa  98.2  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9016  hypothetical protein  30.55 
 
 		 315 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  34.83 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5362  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4981  hypothetical protein  31.86 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.196038  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5069  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 341 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2334  UspA domain-containing protein  35.27 
 
 		 290 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3036  hypothetical protein  32.86 
 
 		 296 aa  96.3  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.456769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2526  UspA domain-containing protein  37.81 
 
 		 296 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  34.28 
 
 		 299 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3433  UspA domain-containing protein  34.39 
 
 		 289 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0719  hypothetical protein  34.98 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0733  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0946433 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  27.34 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0713  UspA domain-containing protein  34.98 
 
 		 294 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.247578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  34.53 
 
 		 277 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4681  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  36.68 
 
 		 288 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22890  universal stress protein UspA-like protein  35.69 
 
 		 300 aa  92.8  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.599041  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  38.66 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1808  UspA domain protein  30.85 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  normal  0.0693032 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0357  hypothetical protein  36.43 
 
 		 300 aa  92.4  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12643  hypothetical protein  31.02 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0989  UspA domain-containing protein  31.83 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4059  UspA domain protein  35.76 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12063  hypothetical protein  32.87 
 
 		 294 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0400  universal stress family protein  28.72 
 
 		 341 aa  90.1  3e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3441  UspA domain-containing protein  35.16 
 
 		 271 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118762  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4841  hypothetical protein  32.75 
 
 		 302 aa  88.6  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5056  UspA domain protein  33.22 
 
 		 291 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.466483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1647  UspA domain-containing protein  35.54 
 
 		 287 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0769263  normal  0.795067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1115  UspA domain-containing protein  32.68 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4999  UspA domain-containing protein  35.46 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1087  hypothetical protein  32.28 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1104  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.213631  normal  0.525734 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  34.98 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5216  UspA domain-containing protein  36.24 
 
 		 298 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.366232  normal  0.453672 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3476  UspA domain-containing protein  33.93 
 
 		 296 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1042  UspA domain protein  32.97 
 
 		 289 aa  85.9  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  32.28 
 
 		 293 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1242  UspA domain protein  33.45 
 
 		 294 aa  85.9  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.683026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1382  UspA domain-containing protein  37.22 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.670048  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  34.49 
 
 		 290 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4996  UspA domain-containing protein  32.6 
 
 		 246 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  32.27 
 
 		 295 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12028  hypothetical protein  32.36 
 
 		 317 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000248719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19610  universal stress protein UspA-like protein  31.08 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.697757  normal  0.0279477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5184  UspA domain protein  36.11 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4870  UspA domain-containing protein  35.38 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2026  UspA domain protein  33.93 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000152786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>