200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2401 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  100 
 
 
276 aa  550  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  47.45 
 
 
340 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  45.98 
 
 
247 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  41.16 
 
 
298 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2566  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  43.2 
 
 
312 aa  198  7.999999999999999e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.108893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  42.28 
 
 
284 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3213  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  42.43 
 
 
325 aa  192  4e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000110595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  41.3 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  44.22 
 
 
308 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  39.14 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1437  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.13 
 
 
315 aa  177  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458748  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2292  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  40.33 
 
 
310 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.636042  normal  0.986884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  36.48 
 
 
302 aa  171  9e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3473  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.91 
 
 
305 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00100108  hitchhiker  0.00465132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  35.41 
 
 
302 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  41.35 
 
 
281 aa  163  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1914  siderophore-interacting protein  33.33 
 
 
300 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3865  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  37.58 
 
 
311 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4105  Siderophore-interacting protein  39.54 
 
 
327 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0779952  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3731  Siderophore-interacting protein  32.45 
 
 
356 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4467  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.76 
 
 
301 aa  151  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3931  siderophore-interacting protein  32.54 
 
 
346 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0924  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.9 
 
 
294 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.11 
 
 
322 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1787  Siderophore-interacting protein  38.17 
 
 
325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00316265  normal  0.123717 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  34.36 
 
 
625 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  37.98 
 
 
265 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  32.53 
 
 
299 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  37.6 
 
 
255 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4183  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.65 
 
 
301 aa  142  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  36.02 
 
 
259 aa  142  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  39 
 
 
257 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  37.35 
 
 
289 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  35.98 
 
 
281 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.96 
 
 
277 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  35.77 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.46 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  35.11 
 
 
267 aa  135  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  37.89 
 
 
623 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  34.91 
 
 
275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  35.16 
 
 
277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0237  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.97 
 
 
266 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  34.83 
 
 
291 aa  132  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  37.3 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04680  siderophore-interacting protein  42.65 
 
 
331 aa  132  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3016  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.35 
 
 
275 aa  132  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565468  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21440  siderophore-interacting protein  34.83 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.522532  normal  0.530536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  38.31 
 
 
277 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.28 
 
 
283 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.27 
 
 
274 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  39.18 
 
 
617 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  34.36 
 
 
275 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.46 
 
 
270 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0589  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  30.38 
 
 
300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.21 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  36.69 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  36.58 
 
 
261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  38.28 
 
 
280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.42 
 
 
273 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35080  siderophore-interacting protein  40.95 
 
 
345 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.32 
 
 
273 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5136  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  32 
 
 
278 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.509715  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  35.06 
 
 
273 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  35.29 
 
 
267 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  34.69 
 
 
273 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  34.66 
 
 
281 aa  122  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  36.82 
 
 
297 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2919  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.71 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  35.06 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  30.45 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.06 
 
 
273 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  33.45 
 
 
270 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  30.04 
 
 
246 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1988  FAD-binding 9, siderophore-interacting  31.88 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2034  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.88 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.870658  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1159  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.92 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139634  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2126  FAD-binding 9, siderophore-interacting  33.46 
 
 
277 aa  119  7e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00704936  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1968  siderophore-interacting protein  31.88 
 
 
285 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0313  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  33.72 
 
 
270 aa  119  7e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.587893  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  36.43 
 
 
283 aa  119  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  34.06 
 
 
281 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  33.07 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  33.7 
 
 
274 aa  117  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09730  siderophore-interacting protein  39.65 
 
 
300 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.222844  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  34.1 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.75 
 
 
296 aa  115  8.999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  34.12 
 
 
252 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  35.91 
 
 
253 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  36.54 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.07 
 
 
248 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  33.96 
 
 
272 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  33.06 
 
 
248 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  35.19 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>