More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2380 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2380  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
670 aa  1304    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.000000186709  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2356  PAS sensor protein  37.13 
 
 
668 aa  317  5e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.621519  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2618  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 
685 aa  147  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 
444 aa  145  2e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
458 aa  143  8e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2531  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
880 aa  143  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  30.31 
 
 
596 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
681 aa  142  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
642 aa  138  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
817 aa  138  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
592 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
958 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0264  PAS  30.85 
 
 
595 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.67 
 
 
770 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2154  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.32555 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
607 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  34.47 
 
 
1020 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
1807 aa  134  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.869779  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
779 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
593 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
596 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0335  sensory box histidine kinase  30.45 
 
 
595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0149  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
593 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  30.25 
 
 
595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
409 aa  132  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
575 aa  132  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
634 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
2783 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3294  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
714 aa  130  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.523166 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2606  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
664 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
594 aa  130  9.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1116  Bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)-like protein  37.23 
 
 
496 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
581 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
453 aa  130  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  37.65 
 
 
776 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
493 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4064  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
639 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.12518  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0350  diguanylate cyclase  35.37 
 
 
776 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0970  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
729 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
489 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
581 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 
1195 aa  128  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 
883 aa  129  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
1252 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
838 aa  127  7e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
674 aa  127  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
608 aa  127  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.99 
 
 
628 aa  127  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.117845  decreased coverage  0.00612296 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
1029 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3764  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
538 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180542  normal  0.0415669 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
2161 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
656 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
821 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2077  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein (sensor for arcA)  36.4 
 
 
492 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0651522  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  31.14 
 
 
586 aa  126  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
551 aa  126  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
502 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2907  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.84 
 
 
520 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
608 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
775 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 
1140 aa  126  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
412 aa  125  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
710 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0994  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
640 aa  125  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.620121  normal  0.0418978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 
587 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2415  PAS sensor protein  27.55 
 
 
810 aa  124  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
1064 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3435  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
605 aa  124  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.188279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1862  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
869 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.557725  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1875  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
501 aa  124  8e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4119  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
380 aa  124  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
896 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
460 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  31.59 
 
 
537 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1148  sensor histidine kinase  33.04 
 
 
604 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 
885 aa  123  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
899 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1264  histidine kinase  38.03 
 
 
421 aa  123  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557954  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 
412 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
725 aa  123  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.302229  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3437  sensory box histidine kinase  36.56 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 
581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1145  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.13 
 
 
532 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0323  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
789 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.179581  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
600 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
361 aa  122  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.121387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  29.51 
 
 
581 aa  121  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 
767 aa  121  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2088  histidine kinase  35.37 
 
 
282 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.409720000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2129  histidine kinase  36.52 
 
 
282 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.136588  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
571 aa  122  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0945672  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
584 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
774 aa  121  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00413354  normal  0.0431838 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.51 
 
 
581 aa  122  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2988  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.633654  normal  0.687189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 
412 aa  121  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>