217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2377 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2377  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 283 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000201287  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4035  transcriptional regulator, XRE family  60.51 
 
 		 326 aa  310  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.808008  normal  0.21338 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3153  transcriptional regulator, XRE family  55.47 
 
 		 290 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6085  transcriptional regulator, XRE family  54.89 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.126069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4588  XRE family transcriptional regulator  49.63 
 
 		 286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000221272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7620  putative transcriptional regulator, XRE family  47.25 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350779  normal  0.254497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7046  helix-turn-helix domain protein  46.13 
 
 		 278 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2980  transcriptional regulator, XRE family  47.71 
 
 		 271 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6833  helix-turn-helix domain protein  41.97 
 
 		 292 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5566  helix-turn-helix domain protein  44.12 
 
 		 281 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2024  putative transcriptional regulator, XRE family  43.22 
 
 		 286 aa  170  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1893  helix-turn-helix domain protein  41.33 
 
 		 285 aa  158  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.792434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2366  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 279 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1305  XRE family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 287 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2575  helix-turn-helix domain protein  37 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4999  transcriptional regulator, XRE family  38.58 
 
 		 301 aa  142  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.662496 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3112  helix-turn-helix domain protein  40.45 
 
 		 279 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000518579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4188  transcriptional regulator, XRE family  38.49 
 
 		 298 aa  142  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16850  Helix-turn-helix protein  38.63 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.950659  normal  0.0208664 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4244  helix-turn-helix domain protein  39.07 
 
 		 287 aa  141  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.649143  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2389  helix-turn-helix domain protein  41.11 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00160745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0700  transcriptional regulator, XRE family  35.64 
 
 		 279 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1333  transcriptional regulator, XRE family  34.4 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4130  transcriptional regulator, XRE family  37.98 
 
 		 292 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.32419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4662  helix-turn-helix domain protein  37.68 
 
 		 287 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1995  helix-turn-helix domain protein  38.81 
 
 		 289 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3948  hypothetical protein  35.2 
 
 		 287 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00019593  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3573  helix-turn-helix domain-containing protein  39.25 
 
 		 281 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.75785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7747  helix-turn-helix domain protein  37.17 
 
 		 276 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2417  transcriptional regulator, XRE family  39.03 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3720  putative transcriptional regulator, XRE family  39.11 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.425271 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3623  hypothetical protein  34.42 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1403  helix-turn-helix domain-containing protein  36.12 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4578  transcriptional regulator, XRE family  38.19 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.78291  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4458  transcriptional regulator, XRE family  36.19 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1062  XRE family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3785  helix-turn-helix domain-containing protein  39.48 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.48754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2460  transcriptional regulator, XRE family  35.14 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1361  XRE family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.108942  hitchhiker  0.000206797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4659  transcriptional regulator, XRE family  35.96 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2109  transcriptional regulator, XRE family  35.42 
 
 		 299 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000611283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3227  helix-turn-helix domain protein  36.94 
 
 		 277 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0313  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 299 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.292673  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4173  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7725  helix-turn-helix domain protein  37.73 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.998664 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1162  XRE family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 281 aa  122  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157815  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4077  helix-turn-helix domain protein  35.56 
 
 		 275 aa  122  9e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.344536  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5457  helix-turn-helix domain-containing protein  33.1 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3963  transcriptional regulator, XRE family  37.54 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.588819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4040  helix-turn-helix domain protein  36.4 
 
 		 300 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.034342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8368  XRE family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4120  helix-turn-helix domain protein  36.96 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0266  XRE family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 301 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0289  transcriptional regulator, XRE family  36 
 
 		 318 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.604604  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3374  transcriptional regulator, XRE family  36.73 
 
 		 310 aa  119  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1949  transcriptional regulator, XRE family  40.67 
 
 		 307 aa  119  6e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3750  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 298 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.169217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1586  transcriptional regulator, XRE family  34.88 
 
 		 317 aa  118  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20270  hypothetical protein  34.41 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.161196 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2188  transcriptional regulator, XRE family  38.28 
 
 		 281 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0492  helix-turn-helix domain protein  33.71 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3092  helix-turn-helix domain protein  37.31 
 
 		 287 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0445  XRE family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 296 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1003  putative transcriptional regulator, XRE family  36.03 
 
 		 291 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2374  helix-turn-helix domain-containing protein  37.73 
 
 		 301 aa  115  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.171601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1690  transcriptional regulator, XRE family  36.86 
 
 		 305 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.33559  normal  0.186529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1970  transcriptional regulator, XRE family  34.8 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997663  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3985  XRE family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0640193  normal  0.244933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  37.27 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0750  XRE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14370  hypothetical protein  34.72 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2562  XRE family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 342 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4741  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.678188  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3425  XRE family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1464  helix-turn-helix domain-containing protein  34.78 
 
 		 301 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1956  putative transcriptional regulator, XRE family  34.17 
 
 		 331 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4445  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.926883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24740  Helix-turn-helix protein  35.19 
 
 		 293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.284325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3008  helix-turn-helix domain protein  35.77 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000207491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3904  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.494464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0368  transcriptional regulator, XRE family  34.85 
 
 		 291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0409  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1288  XRE family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.153102  normal  0.2669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3241  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 299 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7348  hypothetical protein  35.69 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5170  XRE family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.624653  normal  0.480627 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4080  XRE family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0766168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4218  XRE family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4284  XRE family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 289 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0524  hypothetical protein  27.34 
 
 		 276 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1568  transcriptional regulator, XRE family  33.83 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3498  transcriptional regulator, XRE family  36.74 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0180  XRE family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0189  helix-turn-helix domain-containing protein  38.2 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.587332  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3700  transcriptional regulator, XRE family  38.11 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.564208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2649  helix-turn-helix domain-containing protein  32.96 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.21777  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3997  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2137  helix-turn-helix domain protein  34.92 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.291672  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1066  helix-turn-helix domain-containing protein  35.27 
 
 		 289 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2759  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>