More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2363 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2363  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  244  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000390057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0042  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6070  two component response regulator  38.79 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.87 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0666  response regulator receiver  36.21 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2213  DNA binding response regulator KdpE  40.19 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0867  two component transcriptional regulator  37.07 
 
 		 250 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0978  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.62 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0385223 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  42.72 
 
 		 230 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 238 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 234 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.98 
 
 		 234 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 		 816 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5920  two component transcriptional regulator  40.68 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  30.56 
 
 		 240 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 230 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2391  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0298728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  33.64 
 
 		 981 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4239  histidine kinase  37.65 
 
 		 1211 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  38.26 
 
 		 227 aa  57.4  0.00000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  37.29 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  39.83 
 
 		 234 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4142  response regulator receiver domain-containing protein  35.19 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.996905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3504  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1913  response regulator receiver  31.01 
 
 		 566 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.262939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.91 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.94 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4295  response regulator receiver protein  35.92 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.83 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4273  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1240  response regulator receiver  39.13 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3525  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 1197 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2652  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.77 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0662  helix-turn-helix, Fis-type  34.75 
 
 		 451 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1191  response regulator receiver domain-containing protein  29.06 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1017  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957911  normal  0.735899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6334  two-component regulatory system response regulator  35.14 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750595 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0774  sensor protein  28.21 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11471  two-component response regulator, phosphate  35.14 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0202491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2517  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.45 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6752  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.18 
 
 		 230 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3998  two component transcriptional regulator  34.75 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.278973  normal  0.137181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3950  histidine kinase  31.45 
 
 		 589 aa  54.3  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.365281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4608  two component transcriptional regulator  40.78 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3398  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 1202 aa  53.9  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.613847  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4230  two component transcriptional regulator  40.78 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.285059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4296  two component transcriptional regulator  40.78 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0135013  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3012  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0958  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.91 
 
 		 513 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2105  PAS  35.2 
 
 		 680 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.292551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2026  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 		 964 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 483 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.28 
 
 		 1126 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3080  histidine kinase  37.39 
 
 		 1088 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0169759  normal  0.77184 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5840  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.7 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.99298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1773  two component transcriptional regulator  31.93 
 
 		 260 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178114  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1884  response regulator receiver protein  36.59 
 
 		 244 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.365735  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  31.09 
 
 		 230 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1567  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358518  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1786  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00311899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  36.84 
 
 		 229 aa  53.5  0.0000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3099  two component transcriptional regulator  35.19 
 
 		 235 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.663462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1012  response regulator receiver protein  29.73 
 
 		 120 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.175734  normal  0.0400951 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3077  two component transcriptional regulator  30.89 
 
 		 227 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0535977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0170  DNA-binding response regulator  31.71 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1316  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.67 
 
 		 232 aa  53.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0863  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  32.76 
 
 		 351 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297515  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  37.61 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3029  two component transcriptional regulator  39.82 
 
 		 265 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.253727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0241  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  31.86 
 
 		 582 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2094  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1063  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 471 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3826  response regulator receiver  36.15 
 
 		 228 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0204609  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1542  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 224 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.28 
 
 		 226 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  37.86 
 
 		 226 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2165  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  34.78 
 
 		 232 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.77286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6795  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  30.25 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2626  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 392 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 238 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3717  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  35.2 
 
 		 244 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  42.65 
 
 		 910 aa  52  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  36.7 
 
 		 233 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  36.07 
 
 		 237 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.48 
 
 		 755 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 		 520 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2724  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 631 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1865  response regulator receiver  38.46 
 
 		 224 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.59899  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  34.38 
 
 		 236 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>