More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2325 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
760 aa  1521    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  49.67 
 
 
766 aa  655    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  52.85 
 
 
796 aa  739    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3604  ATPase domain-containing protein  57.9 
 
 
742 aa  794    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.864883  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5007  CheA signal transduction histidine kinase  57.74 
 
 
792 aa  626  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0579075  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0314  CheA signal transduction histidine kinase  58.04 
 
 
822 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.181126  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  40.66 
 
 
801 aa  566  1e-160  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1793  CheA signal transduction histidine kinases  54.23 
 
 
870 aa  551  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.63759  normal  0.833682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  40.86 
 
 
910 aa  542  1e-153  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  43.36 
 
 
878 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  44.71 
 
 
728 aa  522  1e-146  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  40.03 
 
 
888 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
911 aa  513  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 
921 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  39.53 
 
 
942 aa  511  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
934 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1809  CheA signal transduction histidine kinase  40.21 
 
 
916 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.45414  normal  0.161294 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1529  ATPase domain-containing protein  40.81 
 
 
916 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.777004  normal  0.0499469 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  46.8 
 
 
928 aa  469  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3678  ATP-binding region, ATPase-like  44.2 
 
 
925 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0781071  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0524  chemotaxis protein cheA  44.46 
 
 
927 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6559  chemotaxis protein cheA  44.28 
 
 
927 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.834779 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  42.83 
 
 
934 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  42.83 
 
 
922 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
921 aa  436  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  45.44 
 
 
935 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  39.3 
 
 
769 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  39.26 
 
 
769 aa  431  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  39.33 
 
 
769 aa  428  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0990  CheA signal transduction histidine kinase  39.94 
 
 
1085 aa  424  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  39.39 
 
 
770 aa  424  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  38.54 
 
 
770 aa  421  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
770 aa  422  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  37.79 
 
 
785 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
598 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0868  CheA signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
1063 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.83 
 
 
774 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  37.85 
 
 
783 aa  409  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  40.41 
 
 
610 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
604 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.15 
 
 
803 aa  401  9.999999999999999e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  39.93 
 
 
603 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 
607 aa  395  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  38.32 
 
 
601 aa  389  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
650 aa  384  1e-105  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
606 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
652 aa  379  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3576  CheA signal transduction histidine kinases  39.26 
 
 
1104 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  36.88 
 
 
639 aa  359  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0065  CheA signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
812 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0656  CheA signal transduction histidine kinase  35.95 
 
 
871 aa  345  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.552424  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1418  CheA signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
713 aa  342  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224123 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1740  CheA signal transduction histidine kinases  32.79 
 
 
807 aa  341  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0607216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0433  CheA signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
730 aa  340  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.645464  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  45.55 
 
 
1089 aa  340  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1577  CheA signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
954 aa  338  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.199949  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00954  chemotaxis protein CheA  35.93 
 
 
552 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.32491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06212  chemotaxis protein CheA  35.93 
 
 
552 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.186307  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0258  putative two-component sensor  37.7 
 
 
625 aa  335  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.678329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  43.75 
 
 
660 aa  332  2e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
1031 aa  332  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
701 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
681 aa  331  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  36.21 
 
 
655 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  39.41 
 
 
736 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
759 aa  328  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1346  ATP-binding region, ATPase-like protein  41.63 
 
 
734 aa  327  6e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1381  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 
741 aa  326  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  42.89 
 
 
754 aa  325  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1386  CheA signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 
746 aa  325  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.524056  normal  0.224897 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 
745 aa  324  4e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1197  chemotaxis protein histidine kinase  33.23 
 
 
887 aa  323  7e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0132818  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0774  CheA signal transduction histidine kinase  45.52 
 
 
1030 aa  323  7e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142014 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
747 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  42.64 
 
 
748 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  42.64 
 
 
758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
747 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
746 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  38.62 
 
 
760 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3107  putative CheA signal transduction histidine kinases  42.48 
 
 
806 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 
697 aa  320  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 
675 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
738 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  42.53 
 
 
741 aa  320  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  40.9 
 
 
681 aa  320  6e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  42.27 
 
 
762 aa  319  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  42.07 
 
 
673 aa  318  2e-85  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0984  chemotaxis sensor histidine kinase  31.69 
 
 
598 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  42.01 
 
 
785 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 
709 aa  318  2e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  42.01 
 
 
758 aa  318  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
733 aa  318  3e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  39.61 
 
 
754 aa  318  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  42.01 
 
 
762 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02250  putative two-component sensor  36.77 
 
 
639 aa  318  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.108586  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0148  chemotaxis protein CheA  38.49 
 
 
720 aa  317  4e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  42.78 
 
 
687 aa  317  4e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  41.36 
 
 
669 aa  317  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0690  CheA signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
673 aa  317  7e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 
747 aa  317  8e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>