More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2302 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2302  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 390 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000026904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6215  major facilitator superfamily MFS_1  41.22 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2122  major facilitator transporter  32.58 
 
 		 424 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.74746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0303  major facilitator superfamily MFS_1  31.17 
 
 		 426 aa  100  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0634781  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0701  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 423 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4378  major facilitator transporter  30.15 
 
 		 431 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1864  putative transporter  25.92 
 
 		 420 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42079e-47 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  26.74 
 
 		 1833 aa  97.4  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2720  putative permease  26.35 
 
 		 412 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.093304  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1780  major facilitator superfamily MFS_1  28.45 
 
 		 403 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.41734  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1684  transporter  25.67 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1819  transporter  25.67 
 
 		 420 aa  96.3  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000952932  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1491  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.326017  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1445  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00616907  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0516  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 420 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  26.58 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  31.53 
 
 		 686 aa  95.1  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1940  putative transporter  25.31 
 
 		 420 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000531086  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1630  transporter  25.67 
 
 		 420 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4102  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 438 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.277859  normal  0.56542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  26.14 
 
 		 440 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 456 aa  92.4  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4222  major facilitator transporter  28.29 
 
 		 432 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.399211  hitchhiker  0.00102981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3061  major facilitator superfamily MFS_1  34.7 
 
 		 429 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00310805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2242  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.370083  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0698  major facilitator superfamily MFS_1  27.08 
 
 		 397 aa  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  32.12 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3365  major facilitator superfamily protein  32.73 
 
 		 424 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2432  permease  25.28 
 
 		 412 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0771594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2393  permease; macrolide-efflux protein  26.35 
 
 		 412 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.366369  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0234  protein of unknown function DUF894, DitE  29.63 
 
 		 419 aa  89.4  9e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1892  transporter, putative  24.69 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0166254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  26.35 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  26.35 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  24.38 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2667  putative permease  25.5 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000524828 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  25 
 
 		 412 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1538  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.756552  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3515  putative transporter  24.01 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1016  major facilitator transporter  32.29 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.807332  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2487  major facilitator transporter  25.57 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000357828  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  25.84 
 
 		 423 aa  87  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 444 aa  86.7  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1600  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1568  major facilitator transporter  26.24 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 418 aa  86.3  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2072  major facilitator transporter  32.82 
 
 		 417 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.205391  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3025  permease, putative  25.94 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.076608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1827  putative transporter  24.5 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  30.81 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0293  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 710 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.189593  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2492  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 438 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0783563  normal  0.106757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 426 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1380  major facilitator superfamily MFS_1  29.82 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.185265  hitchhiker  0.00924404 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1507  macrolide efflux protein  23.68 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.667551  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2820  major facilitator superfamily MFS_1  27.48 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.549151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4618  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1747  major facilitator superfamily MFS_1  30.03 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.192343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  28.76 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  30 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1663  multidrug resistance protein; tetracycline resistance determinant  30.56 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1533  permease  23.98 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1719  putative permease  23.68 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1652  permease  23.98 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.608559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4414  protein of unknown function DUF894, DitE  29.83 
 
 		 557 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.91404 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  23.93 
 
 		 445 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0543  major facilitator superfamily MFS_1  32.47 
 
 		 448 aa  82.8  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5163  protein of unknown function DUF894, DitE  27.85 
 
 		 530 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0799644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2255  putative permease  24.2 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.134353 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1498  macrolide efflux protein  24.63 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2046  hypothetical protein  25.2 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.258697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  30 
 
 		 688 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2678  MFS family major facilitator transporter  24.24 
 
 		 410 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1167  protein of unknown function DUF894, DitE  30.21 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2707  macrolide efflux protein  24.4 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0968867  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2643  major facilitator transporter  25 
 
 		 399 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.238963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1012  protein of unknown function DUF894, DitE  31.34 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.171336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  30.66 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1147  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1536  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2777  permease  24.4 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4728  major facilitator superfamily MFS_1  34.54 
 
 		 444 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.632201 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2988  permease  24.4 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0163  MFS permease  27.78 
 
 		 542 aa  80.1  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0308  dTMP kinase  25.8 
 
 		 709 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.233817 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2726  macrolide efflux protein  24.4 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.277105  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2854  hypothetical protein  28.25 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0001  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 434 aa  80.1  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.51078  hitchhiker  0.00413697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27630  arabinose efflux permease family protein  29.31 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1861  major facilitator transporter  31.81 
 
 		 413 aa  79.3  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0051281 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1505  permease; multidrug resistance protein  24.21 
 
 		 406 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0948022  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1486  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 420 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.467645  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0234  major facilitator superfamily MFS_1  30.49 
 
 		 442 aa  79.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3278  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.471566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>