More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2296 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  100 
 
 
209 aa  416  1e-115  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  2.3308e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  53.66 
 
 
217 aa  200  1e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  49.5 
 
 
217 aa  185  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  50.25 
 
 
217 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  47.34 
 
 
210 aa  177  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  47.44 
 
 
220 aa  175  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  47.03 
 
 
203 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  45.24 
 
 
215 aa  166  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  44.33 
 
 
212 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.98 
 
 
224 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  41.29 
 
 
208 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  42.35 
 
 
218 aa  147  1e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  46.24 
 
 
222 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  43.27 
 
 
209 aa  142  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  40.21 
 
 
219 aa  135  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  43.69 
 
 
232 aa  133  2e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.0187e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  39.44 
 
 
400 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  37.31 
 
 
200 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 
228 aa  117  2e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  37.22 
 
 
200 aa  112  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.27 
 
 
200 aa  109  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  46.96 
 
 
121 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  33.82 
 
 
222 aa  97.4  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  34.24 
 
 
197 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 
214 aa  84.3  1e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
210 aa  84  2e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
197 aa  76.3  3e-13  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  32.72 
 
 
210 aa  75.1  7e-13  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  34.31 
 
 
222 aa  73.6  2e-12  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  40.48 
 
 
305 aa  72  6e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2718  Methyltransferase type 12  29.33 
 
 
204 aa  70.5  2e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 
291 aa  69.7  3e-11  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  42 
 
 
319 aa  69.7  3e-11  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
210 aa  69.7  3e-11  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  34.46 
 
 
234 aa  68.9  5e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.8 
 
 
237 aa  68.6  7e-11  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
225 aa  68.2  8e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
309 aa  67.4  2e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  39.6 
 
 
201 aa  66.6  2e-10  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 
218 aa  66.2  3e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
226 aa  66.6  3e-10  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  31.08 
 
 
219 aa  66.2  3e-10  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  1.27157e-05 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  38.61 
 
 
201 aa  65.5  5e-10  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  38.61 
 
 
201 aa  65.5  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  38.61 
 
 
201 aa  65.5  5e-10  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  38.61 
 
 
201 aa  65.9  5e-10  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
238 aa  65.5  5e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  38.61 
 
 
201 aa  65.5  5e-10  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  39 
 
 
199 aa  65.9  5e-10  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  38.61 
 
 
201 aa  65.5  5e-10  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
201 aa  65.5  6e-10  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  36.3 
 
 
195 aa  64.3  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  25.58 
 
 
221 aa  64.3  1e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
257 aa  64.3  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 
195 aa  64.3  1e-09  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.6 
 
 
224 aa  63.5  2e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.58 
 
 
216 aa  63.9  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
225 aa  63.5  2e-09  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  29.21 
 
 
211 aa  63.9  2e-09  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  33.33 
 
 
200 aa  63.2  3e-09  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
226 aa  63.2  3e-09  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0334  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
272 aa  63.2  3e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.530164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
202 aa  63.2  3e-09  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  24.32 
 
 
215 aa  62.4  4e-09  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  28.71 
 
 
227 aa  62.8  4e-09  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.66 
 
 
230 aa  62.4  4e-09  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
260 aa  62.4  5e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 
208 aa  62  6e-09  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  32.19 
 
 
196 aa  62  6e-09  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  41.58 
 
 
200 aa  62  7e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.14 
 
 
241 aa  61.6  8e-09  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4877  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
246 aa  61.6  9e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0888131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
252 aa  60.8  1e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.82 
 
 
206 aa  60.8  1e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.97 
 
 
265 aa  60.8  1e-08  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  40 
 
 
267 aa  61.2  1e-08  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.97 
 
 
235 aa  60.8  1e-08  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  33.08 
 
 
325 aa  60.1  2e-08  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  31.93 
 
 
255 aa  60.1  2e-08  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
242 aa  60.5  2e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
201 aa  60.5  2e-08  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
364 aa  60.5  2e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  30 
 
 
208 aa  60.1  2e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87708  predicted protein  38 
 
 
267 aa  60.1  2e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
201 aa  60.1  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
200 aa  59.7  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  34.9 
 
 
195 aa  59.7  3e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
270 aa  59.7  3e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.67 
 
 
200 aa  59.7  3e-08  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
270 aa  59.7  3e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
273 aa  59.7  3e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
270 aa  59.7  3e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  27.78 
 
 
218 aa  59.3  4e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.21 
 
 
243 aa  59.3  4e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
240 aa  59.3  4e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  27.53 
 
 
213 aa  59.3  4e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  31.85 
 
 
202 aa  58.9  5e-08  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  32.19 
 
 
243 aa  58.9  5e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  36.7 
 
 
215 aa  58.9  5e-08  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  34.13 
 
 
275 aa  59.3  5e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>