212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2251 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2251  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  100 
 
 		 114 aa  205  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.624721  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4869  twin arginine-targeting protein translocase  76 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167987  normal  0.115935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2607  twin arginine-targeting protein translocase  62.16 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181166  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2319  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  64.71 
 
 		 103 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000189125  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3667  twin arginine-targeting protein translocase  52 
 
 		 74 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1503  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  61.22 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.432776  hitchhiker  0.000608688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1204  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  45.68 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3980  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  43.24 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.368125  normal  0.0318419 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1515  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  50.55 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00781786  normal  0.224045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1769  twin-arginine translocation protein TatA/E  59.52 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.506415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12129  twin arginine translocase protein A  55.81 
 
 		 115 aa  57  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119011  normal  0.626487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2474  twin arginine translocase protein A  39.19 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2519  twin arginine translocase protein A  39.19 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2511  twin arginine translocase protein A  39.19 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256791  normal  0.624979 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32.58 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2305  twin arginine translocase protein A  62 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0188826  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3093  twin arginine translocase protein A  45.76 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370382  normal  0.391884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3837  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  25.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.669997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0195  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  56.76 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3442  twin arginine translocase protein A  41.79 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.385779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2370  twin arginine translocase protein A  51.92 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.730984  hitchhiker  0.00440018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0200  twin arginine translocase protein A  38.46 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000520781  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  41.38 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  35.29 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5859  sec-independent translocation protein MttA/Hcf106  65.96 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1290  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  45.16 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2549  Sec-independent protein translocase TatA  40.85 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.130237  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  35.38 
 
 		 87 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  48.98 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3893  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  38.89 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000775372  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  42 
 
 		 60 aa  50.8  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1795  twin-arginine translocation protein TatA/E  33.33 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  41.1 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  35.48 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1926  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  44.64 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000393248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.84 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  52.5 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2689  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  46.3 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0022  twin arginine translocase protein A  33.33 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0483524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  42.11 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  37.66 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  32.95 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0240  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.77 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.443858  normal  0.816195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  37.66 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  37.66 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  46.94 
 
 		 61 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  44.07 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4453  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  53.85 
 
 		 87 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230373  normal  0.0943376 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4378  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  51.11 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.600878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3045  Sec-independent protein translocase protein TatA  37.5 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  28.28 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2679  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  39.06 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3728  twin arginine-targeting protein translocase  38.03 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  44.19 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0040  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  36.84 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.620384  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0544  twin arginine-targeting protein translocase  40.48 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0291571  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  38.03 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  38.03 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  35.09 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  35.09 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1749  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.82 
 
 		 58 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1725  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.82 
 
 		 58 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  32.22 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3795  twin arginine-targeting protein translocase  31.76 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2333  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  41.51 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.192204  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21960  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  54.55 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.148281  normal  0.304965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  32.05 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18530  twin arginine-targeting protein translocase, TatA/E family  51.92 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0332142  decreased coverage  0.00893017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2352  twin arginine translocase protein A  36.54 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0320  twin arginine-targeting protein translocase  36.23 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24611  twin arginine translocase protein A  38.3 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1920  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.71 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0787289  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0251  twin arginine-targeting protein translocase  44.23 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.293668 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0115  twin arginine translocase protein A  29.07 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.534703 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2436  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  52.5 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0472  twin arginine-targeting protein translocase  34.72 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2652  twin arginine-targeting protein translocase  55.77 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.572667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1823  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  54.9 
 
 		 105 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>