54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2221 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2221  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986001  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22150  hypothetical protein  56.65 
 
 		 263 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0416254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0667  hypothetical protein  48.46 
 
 		 276 aa  199  5e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0380148  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2310  hypothetical protein  41.7 
 
 		 262 aa  187  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.435195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4110  hypothetical protein  43.14 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.240561  normal  0.49324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4900  hypothetical protein  42.75 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0766  hypothetical protein  41.41 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2054  hypothetical protein  35.41 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000089392 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2236  hypothetical protein  40.15 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2017  hypothetical protein  40.15 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2063  hypothetical protein  40.15 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1998  hypothetical protein  41.18 
 
 		 262 aa  169  5e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2000  hypothetical protein  43.14 
 
 		 280 aa  168  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.388809 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2774  hypothetical protein  42.41 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2327  hypothetical protein  35.04 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.398792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1506  hypothetical protein  36.15 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.168782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2983  hypothetical protein  39.69 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7017  hypothetical protein  36.36 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320155 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1417  hypothetical protein  36.08 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15480  hypothetical protein  34.65 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00643859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1720  hypothetical protein  33.73 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2000  hypothetical protein  31.85 
 
 		 271 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.422215  normal  0.170887 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4344  hypothetical protein  38.15 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3464  hypothetical protein  36.3 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.611516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3063  hypothetical protein  36.47 
 
 		 264 aa  142  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.129455 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0865  hypothetical protein  35.57 
 
 		 257 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5190  hypothetical protein  34.92 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391316  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10540  hypothetical protein  34.59 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.11001  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0975  hypothetical protein  33.59 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3150  hypothetical protein  38.58 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3138  hypothetical protein  38.28 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3200  hypothetical protein  38.28 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  0.212983 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2330  hypothetical protein  35.61 
 
 		 270 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.965194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0968  hypothetical protein  34.38 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1778  hypothetical protein  34.41 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00279828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0712  hypothetical protein  32.05 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.0660006 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0454  hypothetical protein  33.98 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2151  hypothetical protein  35.04 
 
 		 276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0579  hypothetical protein  30.52 
 
 		 270 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0365953  normal  0.114507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3159  hypothetical protein  34.98 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0654278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2268  hypothetical protein  31.52 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.824369  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2455  hypothetical protein  31.18 
 
 		 287 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0790  hypothetical protein  30.86 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4522  hypothetical protein  28.99 
 
 		 284 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3647  hypothetical protein  24.61 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.51576  hitchhiker  0.00000000000126361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0060  hypothetical protein  28.74 
 
 		 268 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2565  hypothetical protein  29.22 
 
 		 270 aa  52  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2573  hypothetical protein  29.22 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2528  hypothetical protein  29.22 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0062  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.847776  normal  0.0297452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.257103  normal  0.0357536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0053  hypothetical protein  27.27 
 
 		 276 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0984909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3143  hypothetical protein  28.35 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.205531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4087  hypothetical protein  25.87 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>