87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2210 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  100 
 
 
298 aa  604  9.999999999999999e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  75 
 
 
290 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  67.87 
 
 
296 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  66.06 
 
 
288 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  66.55 
 
 
296 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  66.55 
 
 
296 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  66.19 
 
 
296 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  67.53 
 
 
286 aa  387  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  67.03 
 
 
286 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  63.83 
 
 
301 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  61.29 
 
 
283 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  62.2 
 
 
292 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  62.36 
 
 
280 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  59.56 
 
 
284 aa  331  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  58.52 
 
 
282 aa  330  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  58.7 
 
 
284 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  57.04 
 
 
289 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  61.76 
 
 
280 aa  324  1e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  56.69 
 
 
289 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  59.71 
 
 
286 aa  317  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  58.61 
 
 
279 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  58.06 
 
 
281 aa  308  9e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  55.2 
 
 
285 aa  301  1e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  56.55 
 
 
294 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  52.24 
 
 
301 aa  291  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  52.61 
 
 
301 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  51.99 
 
 
306 aa  281  6.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  53.52 
 
 
302 aa  279  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  51.65 
 
 
283 aa  278  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  53.31 
 
 
283 aa  278  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  49.11 
 
 
282 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  51.76 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  47.43 
 
 
296 aa  252  6e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  43.1 
 
 
297 aa  245  6.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  43.21 
 
 
299 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  46.24 
 
 
269 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  44.64 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  40 
 
 
311 aa  201  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  28.52 
 
 
277 aa  143  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  36.43 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  30.58 
 
 
311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  28.67 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  30.66 
 
 
311 aa  120  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  28.32 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  28.32 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  27.84 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  28.32 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  30.65 
 
 
306 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  30 
 
 
306 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  28.71 
 
 
313 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  27.6 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  33.33 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  28.01 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  27.55 
 
 
307 aa  109  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  29.43 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  32.94 
 
 
316 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  28.47 
 
 
314 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  29.19 
 
 
302 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  29.03 
 
 
324 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  29.55 
 
 
311 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.57 
 
 
312 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  29.31 
 
 
304 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  26.15 
 
 
301 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  27.49 
 
 
304 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  27.93 
 
 
310 aa  103  5e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.78 
 
 
348 aa  102  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  27.76 
 
 
312 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  28.52 
 
 
325 aa  100  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  27.05 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  26.95 
 
 
307 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  28.12 
 
 
312 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  26.54 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  26.81 
 
 
312 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  27.4 
 
 
353 aa  90.5  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  27.72 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  26.21 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  23.78 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  24.38 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  23.55 
 
 
276 aa  64.7  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  23.55 
 
 
276 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.71 
 
 
302 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  22 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  22.71 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  22.73 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0799  hypothetical protein  22.42 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.515819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>