More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2110 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  82.73 
 
 		 249 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  82.07 
 
 		 251 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  82.07 
 
 		 250 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  80.88 
 
 		 251 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  80.4 
 
 		 251 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  79.52 
 
 		 250 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  79.52 
 
 		 249 aa  414  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  78.4 
 
 		 250 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  78.4 
 
 		 250 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  78.4 
 
 		 250 aa  411  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  78.71 
 
 		 249 aa  407  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  78.71 
 
 		 249 aa  410  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  78 
 
 		 252 aa  407  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  81.27 
 
 		 251 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  77.11 
 
 		 249 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  77.51 
 
 		 249 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  77.29 
 
 		 251 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  77.6 
 
 		 251 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  78.09 
 
 		 251 aa  401  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  77.29 
 
 		 253 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  74.31 
 
 		 255 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2299  protein of unknown function DUF28  80.08 
 
 		 251 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  77.11 
 
 		 250 aa  396  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  76.8 
 
 		 252 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  75.1 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  70.4 
 
 		 252 aa  363  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5147  hypothetical protein  71.14 
 
 		 251 aa  357  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000302619  decreased coverage  0.000117077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  71.54 
 
 		 251 aa  355  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  66.4 
 
 		 251 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2383  hypothetical protein  66.41 
 
 		 259 aa  347  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  67.87 
 
 		 254 aa  340  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2304  hypothetical protein  64.54 
 
 		 251 aa  328  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0897914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1665  protein of unknown function DUF28  67.19 
 
 		 256 aa  327  8e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0741834  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2034  hypothetical protein  64.94 
 
 		 251 aa  322  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000103921 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  61.6 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  62 
 
 		 251 aa  297  9e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12910  conserved hypothetical protein TIGR01033  61.11 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.335721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  51 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  54.62 
 
 		 250 aa  258  9e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  51 
 
 		 247 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  53.01 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  50.2 
 
 		 253 aa  248  8e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  49 
 
 		 250 aa  246  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  49.2 
 
 		 247 aa  244  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  48.99 
 
 		 250 aa  244  9e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  49.2 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50.41 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50.2 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  46.72 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  49.4 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  49.39 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  49.8 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  48.16 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  46.22 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  44.98 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  46.37 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.81 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.81 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.81 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.81 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  47.81 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  47.81 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  47.41 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  48.18 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  44.58 
 
 		 253 aa  231  9e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  47.41 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  50.6 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  48.21 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.4 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  48.21 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  46.31 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  47.81 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  46.03 
 
 		 250 aa  226  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  45.42 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  44.76 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  49.19 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  49.4 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.15 
 
 		 247 aa  226  4e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  49 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  45.82 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  49.4 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  46.47 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  48.21 
 
 		 246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>