65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2096 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2096  protein of unknown function DUF1696  100 
 
 
125 aa  256  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00367109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1634  protein of unknown function DUF1696  75 
 
 
124 aa  205  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0936562  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11460  Protein of unknown function (DUF1696)  55.65 
 
 
125 aa  160  7e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001163  GTPases - Sulfate adenylate transferase subunit 1  52.8 
 
 
125 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04942  hypothetical protein  57.41 
 
 
122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0450  protein of unknown function DUF1696  38.14 
 
 
129 aa  100  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00191291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1018  hypothetical protein  46.23 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2764  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.527603  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2698  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  95.9  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.929061  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2439  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.286833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2712  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000335189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2513  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  95.9  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0384558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2474  hypothetical protein  40.18 
 
 
125 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000514005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3967  hypothetical protein  50.6 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.12915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2445  hypothetical protein  39.29 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00267859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0848  hypothetical protein  49.38 
 
 
124 aa  94.7  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2235  protein of unknown function DUF1696  36.84 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0790271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2592  hypothetical protein  38.39 
 
 
125 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0276501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00781  hypothetical protein  46.51 
 
 
124 aa  94.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.484953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0678  hypothetical protein  44.86 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1053  hypothetical protein  46.6 
 
 
125 aa  94  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0950  hypothetical protein  41.67 
 
 
124 aa  93.6  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2961  hypothetical protein  41.12 
 
 
124 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0280787 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1246  hypothetical protein  42.99 
 
 
125 aa  93.2  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000430904  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0765  hypothetical protein  46.91 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1632  protein of unknown function DUF1696  44.04 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0378038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0819  hypothetical protein  46.51 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5218  protein of unknown function DUF1696  48.81 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0454954  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4419  protein of unknown function DUF1696  40.57 
 
 
124 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.30953 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0972  hypothetical protein  51.32 
 
 
121 aa  92  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.376693  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17100  Protein of unknown function (DUF1696)  41.28 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.319625 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2717  hypothetical protein  37.5 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.518369  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4366  hypothetical protein  40.74 
 
 
125 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3944  hypothetical protein  39.62 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.195565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4312  protein of unknown function DUF1696  39.62 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2968  protein of unknown function DUF1696  42.71 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000823184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3796  hypothetical protein  39.81 
 
 
124 aa  90.5  8e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0224  hypothetical protein  39.13 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181934  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1528  hypothetical protein  43.27 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00537923  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3704  hypothetical protein  38.89 
 
 
124 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3581  hypothetical protein  39.81 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0735  hypothetical protein  38.89 
 
 
124 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1530  hypothetical protein  48.1 
 
 
125 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0801  hypothetical protein  40.74 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3513  protein of unknown function DUF1696  38.89 
 
 
124 aa  89  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.10394 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0829  hypothetical protein  39.81 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3137  hypothetical protein  39.81 
 
 
124 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26210  Protein of unknown function (DUF1696)  41.28 
 
 
121 aa  87  8e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0252332  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1850  hypothetical protein  37.74 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.468949  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0773  hypothetical protein  38.18 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.39143  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2100  protein of unknown function DUF1696  44.55 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.320981  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1562  hypothetical protein  42.42 
 
 
127 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.520786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3190  protein of unknown function DUF1696  35.54 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000000611457  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2411  hypothetical protein  45.83 
 
 
94 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.342791  normal  0.0159601 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0362  hypothetical protein  30.51 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.461956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6260  hypothetical protein  29.81 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0448262 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4595  hypothetical protein  35.94 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000933479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4322  hypothetical protein  35.94 
 
 
204 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000820801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4710  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  40  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000186884  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4373  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  40  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000851345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4564  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4614  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4220  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  40  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4210  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4570  hypothetical protein  34.38 
 
 
204 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.103016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>