More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2077 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2077  peptidase C26  100 
 
 
233 aa  454  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1757  peptidase C26  55.07 
 
 
231 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.721348  normal  0.077261 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2465  peptidase C26  51.52 
 
 
247 aa  203  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12875  amidotransferase  48.94 
 
 
272 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.853598  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1636  peptidase C26  51.95 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.370641  normal  0.14821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4064  peptidase C26  48.56 
 
 
256 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4227  peptidase C26  49.79 
 
 
260 aa  185  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135339  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2279  peptidase C26  46.67 
 
 
280 aa  185  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.249131 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1848  peptidase C26  46.61 
 
 
251 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.845506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2584  peptidase C26  50.66 
 
 
237 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0482191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4415  peptidase C26  48.23 
 
 
255 aa  177  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.663907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  44.59 
 
 
241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  44.49 
 
 
251 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2041  peptidase C26  44.4 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755428  normal  0.5084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2104  peptidase C26  44.4 
 
 
240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.297238  normal  0.0236912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1798  peptidase C26  43.28 
 
 
247 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.720671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  39.66 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  42.13 
 
 
243 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  37.66 
 
 
233 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3991  hypothetical protein  47.62 
 
 
229 aa  138  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  43.46 
 
 
236 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  41.26 
 
 
268 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  34.83 
 
 
238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  42.98 
 
 
236 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  42.55 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  41.2 
 
 
275 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  41.7 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  43.22 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  39.52 
 
 
240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  34.17 
 
 
242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12430  predicted glutamine amidotransferase  38.46 
 
 
247 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4408  peptidase C26  41.41 
 
 
262 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.92 
 
 
241 aa  124  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  37.71 
 
 
237 aa  124  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1740  peptidase C26  40.6 
 
 
241 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.227165  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  35.59 
 
 
237 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3159  peptidase C26  38.87 
 
 
261 aa  122  7e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19230  predicted glutamine amidotransferase  36.1 
 
 
273 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0453236 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  31.09 
 
 
238 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.78 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  35.37 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1964  peptidase C26  38.02 
 
 
239 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1392  hypothetical protein  40.89 
 
 
215 aa  118  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  34.09 
 
 
238 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  38.53 
 
 
233 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0837  peptidase C26  40.25 
 
 
277 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.347165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  39.24 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08940  predicted glutamine amidotransferase  38.43 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0342497  normal  0.666279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  40.85 
 
 
312 aa  116  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  36.19 
 
 
298 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04810  predicted glutamine amidotransferase  36.89 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00756632  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  36.06 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2532  peptidase C26  35.24 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0498  peptidase C26  37.78 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28505  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0509  peptidase C26  37.78 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  36.71 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  41.03 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1429  glutamine amidotransferase (class I), putative  32.89 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0520  peptidase C26  37.78 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  33.74 
 
 
264 aa  113  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1160  peptidase C26  38.56 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1963  peptidase C26  41.44 
 
 
254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.153313  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  38.46 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  38.66 
 
 
238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  34.16 
 
 
602 aa  112  7.000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  33.94 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  33.96 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  37.09 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  37.09 
 
 
250 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  34.93 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  36.28 
 
 
251 aa  109  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  34.93 
 
 
248 aa  109  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  29.34 
 
 
245 aa  109  5e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3925  peptidase C26  36.78 
 
 
240 aa  108  7.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.792522  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3249  peptidase C26  39.51 
 
 
250 aa  107  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  31.53 
 
 
244 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  32.42 
 
 
241 aa  106  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  36.63 
 
 
250 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4921  peptidase C26  35.86 
 
 
299 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  35.65 
 
 
235 aa  105  6e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  39.51 
 
 
260 aa  105  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7501  glutamine amidotransferase, class I  42.19 
 
 
230 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  33.95 
 
 
259 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1367  peptidase C26  39.02 
 
 
239 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  36.87 
 
 
253 aa  102  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1853  peptidase C26  43.02 
 
 
270 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.467873  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1297  peptidase C26  36.04 
 
 
259 aa  101  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.266099  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  36.19 
 
 
264 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2749  peptidase C26  35.69 
 
 
262 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  33.2 
 
 
245 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0982  glutamine amidotransferase, class I  35.22 
 
 
278 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1797  glutamine amidotransferase  34.12 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.239238  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0921  glutamine amidotransferase, class I  35.22 
 
 
278 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.216457  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0608  peptidase C26  44.52 
 
 
237 aa  99.8  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.982002  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  32.16 
 
 
227 aa  99.8  4e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1082  peptidase C26  34.93 
 
 
259 aa  99  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.3752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  35.33 
 
 
267 aa  99  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0847  peptidase C26  38.31 
 
 
246 aa  98.6  7e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  35.37 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  39.78 
 
 
285 aa  98.2  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>