More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2036 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2036  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 
388 aa  753    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10960  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  45.91 
 
 
403 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0724  monooxygenase FAD-binding  46.68 
 
 
408 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.30015 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5899  monooxygenase FAD-binding  46.44 
 
 
398 aa  297  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196665 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0135  monooxygenase FAD-binding  47.47 
 
 
400 aa  293  5e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0093  flavoprotein monooxygenase  44.1 
 
 
467 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3917  putative oxidoreductase  41.07 
 
 
397 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280043  normal  0.0698195 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1283  monooxygenase FAD-binding protein  42.63 
 
 
403 aa  252  8.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514503 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0299  monooxygenase  42.24 
 
 
351 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2424  monooxygenase FAD-binding protein  42.24 
 
 
393 aa  216  4e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.127723  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3006  monooxygenase FAD-binding protein  37.07 
 
 
404 aa  199  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00211074 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0387  monooxygenase FAD-binding  33.95 
 
 
402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.491614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4063  monooxygenase FAD-binding protein  38.14 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0067  monooxygenase FAD-binding protein  40.72 
 
 
400 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7487  putative oxidoreductase  34.9 
 
 
399 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2360  monooxygenase, FAD-binding protein  36.57 
 
 
400 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.175962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2407  monooxygenase, FAD-binding  36.57 
 
 
400 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.254272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2401  monooxygenase, FAD-binding  36.57 
 
 
400 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7249  monooxygenase FAD-binding  37.67 
 
 
377 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2022  putative oxidoreductase  33.83 
 
 
407 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.461121  normal  0.126773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2729  hypothetical protein  31.52 
 
 
415 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0928  monooxygenase FAD-binding  35.34 
 
 
424 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.607239  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5557  monooxygenase FAD-binding protein  35.86 
 
 
371 aa  176  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1039  putative oxidoreductase  37.85 
 
 
387 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0582367  normal  0.0597058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1462  monooxygenase FAD-binding  31.84 
 
 
390 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000001589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1719  monooxygenase FAD-binding protein  34.43 
 
 
402 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.861582  normal  0.177423 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11286  hypothetical protein  35.59 
 
 
372 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0549  monooxygenase FAD-binding  30.03 
 
 
380 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.554692  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4777  monooxygenase FAD-binding protein  32.09 
 
 
496 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.712751  hitchhiker  0.00463722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5927  monooxygenase FAD-binding protein  34.28 
 
 
400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01821  FAD-binding monooxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07040)  30.3 
 
 
423 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00520599  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3892  monooxygenase FAD-binding protein  33.51 
 
 
396 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.116118  normal  0.359829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4249  monooxygenase FAD-binding  30.62 
 
 
370 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.850855  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26790  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  34.67 
 
 
398 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15237  normal  0.462192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5341  monooxygenase FAD-binding protein  33.51 
 
 
418 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2496  putative oxidoreductase  35.96 
 
 
374 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.117419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2591  hypothetical protein  33.42 
 
 
389 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000360209  hitchhiker  0.000709187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8153  monooxygenase FAD-binding protein  33.69 
 
 
424 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.976532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2957  monooxygenase FAD-binding  27.57 
 
 
372 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  hitchhiker  0.00000079656 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5428  hypothetical protein  30.38 
 
 
394 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235903 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1977  monooxygenase FAD-binding protein  36.97 
 
 
393 aa  150  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.0000420901  unclonable  0.000000044053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10585  hypothetical protein  33.15 
 
 
388 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000190201  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0385  hypothetical protein  33.69 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3005  monooxygenase FAD-binding  37.23 
 
 
411 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4094  FAD dependent oxidoreductase  35.77 
 
 
413 aa  146  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.232539  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3990  monooxygenase FAD-binding  30.55 
 
 
415 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4005  monooxygenase FAD-binding  35.03 
 
 
396 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.888605  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6278  monooxygenase FAD-binding  33.42 
 
 
393 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.435986  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2116  monooxygenase FAD-binding protein  29.59 
 
 
384 aa  137  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.400145  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4701  putative oxidoreductase transmembrane protein  31.49 
 
 
381 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105263  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5767  putative oxidoreductase transmembrane protein  30.08 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117987  normal  0.249872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1142  monooxygenase FAD-binding  31.96 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000665044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4470  FAD dependent oxidoreductase  31.82 
 
 
371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4339  monooxygenase FAD-binding  32.43 
 
 
434 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4615  monooxygenase FAD-binding  32.94 
 
 
392 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992897  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1253  monooxygenase, FAD-binding  31.67 
 
 
388 aa  123  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420129  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1265  monooxygenase FAD-binding protein  33.16 
 
 
396 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.717662  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1494  monooxygenase, FAD-binding  31.75 
 
 
386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.379752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  31.43 
 
 
408 aa  110  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1730  monooxygenase, FAD-binding  30.59 
 
 
395 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28690  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  31.62 
 
 
387 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1561  hypothetical protein  31.86 
 
 
377 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2471  monooxygenase FAD-binding  28.78 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  30.28 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2149  monooxygenase FAD-binding protein  22.5 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.438269  normal  0.289576 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  29.21 
 
 
408 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0503  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
376 aa  90.1  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0568  monooxygenase FAD-binding  30.08 
 
 
376 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  28.53 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0950  monooxygenase, FAD-binding  24.32 
 
 
368 aa  87  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0960  monooxygenase, FAD-binding  24.01 
 
 
368 aa  86.7  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.234631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2657  monooxygenase, FAD-binding  28.62 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.751067  normal  0.222603 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5490  hypothetical protein  25.82 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  29.01 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  28.83 
 
 
404 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  30.3 
 
 
409 aa  83.6  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2393  hypothetical protein  27.54 
 
 
376 aa  82.4  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142228  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  29.1 
 
 
388 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0859  hypothetical protein  24.07 
 
 
376 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  31.25 
 
 
388 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2779  monooxygenase FAD-binding  29.87 
 
 
411 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0421282 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  27.43 
 
 
377 aa  80.1  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  28.7 
 
 
404 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4891  monooxygenase, FAD-binding  29.17 
 
 
402 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2786  monooxygenase FAD-binding protein  25.81 
 
 
408 aa  79.3  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00390244  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  28.61 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.37 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3140  hypothetical protein  24.57 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1936  hypothetical protein  27.41 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3284  monooxygenase FAD-binding protein  27.82 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.289154 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  28.7 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  29.81 
 
 
398 aa  77  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  27.4 
 
 
377 aa  76.6  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  28.77 
 
 
402 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  30.56 
 
 
397 aa  76.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  27.81 
 
 
400 aa  76.3  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  28.66 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  27.66 
 
 
404 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  26.95 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  22.07 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>