More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2031 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  100 
 
 		 500 aa  954    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  53.88 
 
 		 595 aa  416  9.999999999999999e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  50 
 
 		 633 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  55.2 
 
 		 619 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  51.24 
 
 		 626 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  45.43 
 
 		 611 aa  349  5e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  50.74 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  38.7 
 
 		 623 aa  268  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  38.98 
 
 		 625 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  38.42 
 
 		 619 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  37.25 
 
 		 625 aa  252  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  38.52 
 
 		 615 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 616 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  38.27 
 
 		 621 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 626 aa  245  9.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  37.28 
 
 		 615 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  35.63 
 
 		 592 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  37.89 
 
 		 621 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  38.57 
 
 		 618 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  37.89 
 
 		 621 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  36.4 
 
 		 631 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  38.33 
 
 		 618 aa  240  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  37 
 
 		 609 aa  239  8e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  41.4 
 
 		 625 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  35.22 
 
 		 613 aa  238  2e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.58 
 
 		 600 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  37.33 
 
 		 621 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  36.28 
 
 		 614 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  34.55 
 
 		 604 aa  233  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  38.12 
 
 		 618 aa  233  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  38.55 
 
 		 623 aa  232  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  34.64 
 
 		 611 aa  230  5e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 623 aa  230  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  37.05 
 
 		 603 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  31.48 
 
 		 605 aa  223  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.77 
 
 		 633 aa  219  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  39.1 
 
 		 638 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  34.96 
 
 		 618 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  32.47 
 
 		 611 aa  217  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.75 
 
 		 603 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  36.75 
 
 		 606 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  35.13 
 
 		 613 aa  216  9.999999999999999e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  35.13 
 
 		 626 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  28.85 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  40.81 
 
 		 599 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.73 
 
 		 603 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  45.59 
 
 		 604 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.74 
 
 		 585 aa  206  6e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  36.95 
 
 		 605 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  35.87 
 
 		 608 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3226  ABC transporter related  34.54 
 
 		 589 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  39.4 
 
 		 584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  37.77 
 
 		 578 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  42.09 
 
 		 636 aa  200  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5589  ABC transporter related  37.09 
 
 		 586 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.239787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  39.2 
 
 		 641 aa  200  5e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  43.8 
 
 		 647 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  31.99 
 
 		 579 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 594 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  38.8 
 
 		 600 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 598 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  40.69 
 
 		 591 aa  196  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.76 
 
 		 584 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  41.25 
 
 		 573 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.15 
 
 		 588 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  40.77 
 
 		 579 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1454  ABC transporter related  33.59 
 
 		 600 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  37.71 
 
 		 610 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.71 
 
 		 609 aa  193  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  36.19 
 
 		 662 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.86 
 
 		 588 aa  193  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.11 
 
 		 589 aa  193  8e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.38 
 
 		 594 aa  192  1e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  30.97 
 
 		 741 aa  192  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  32.28 
 
 		 739 aa  192  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  27.55 
 
 		 606 aa  192  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  42.86 
 
 		 582 aa  191  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  34.89 
 
 		 705 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0387  lipid A ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.72 
 
 		 586 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  37.2 
 
 		 720 aa  192  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  34.17 
 
 		 673 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 596 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  46.61 
 
 		 611 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.39 
 
 		 590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  33.4 
 
 		 616 aa  191  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  31.75 
 
 		 610 aa  191  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  37.91 
 
 		 712 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  37.04 
 
 		 608 aa  190  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.86 
 
 		 587 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  38.04 
 
 		 639 aa  190  5.999999999999999e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  40.79 
 
 		 594 aa  190  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  37.07 
 
 		 649 aa  189  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  39.64 
 
 		 572 aa  189  8e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08270  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.08 
 
 		 596 aa  189  9e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00203006  normal  0.441586 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  39.13 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 720 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1067  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  35.44 
 
 		 603 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0347  ABC transporter related  37.12 
 
 		 647 aa  188  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.836066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2067  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  40.82 
 
 		 586 aa  188  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  43.01 
 
 		 567 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>