43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1969 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1969  Triacylglycerol lipase  100 
 
 
285 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000010339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  67.67 
 
 
323 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3830  Triacylglycerol lipase  68.08 
 
 
298 aa  360  2e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0300878  normal  0.0105482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1278  Triacylglycerol lipase  66.93 
 
 
289 aa  358  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.332375  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0390  Triacylglycerol lipase  66.54 
 
 
292 aa  352  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  61.6 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  61.98 
 
 
319 aa  334  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4588  Triacylglycerol lipase  60.57 
 
 
311 aa  330  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4623  Triacylglycerol lipase  62.83 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27960  cutinase  62.64 
 
 
304 aa  308  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.391001  normal  0.108807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  51.77 
 
 
319 aa  291  7e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4911  Ricin B lectin  46.95 
 
 
472 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.036155  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2738  Ricin B lectin  45.53 
 
 
468 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.176429 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0247  hypothetical protein  26.84 
 
 
286 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.698078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4244  peptidase S15  37.27 
 
 
256 aa  55.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100247  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  23.39 
 
 
430 aa  52.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  22.96 
 
 
380 aa  52.4  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0723  dienelactone hydrolase  29.41 
 
 
281 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3960  secreted protein  32.58 
 
 
815 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0122355  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4884  hypothetical protein  24.08 
 
 
285 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205762  normal  0.0606988 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0851  dienelactone hydrolase  28.1 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6636  hypothetical protein  30.89 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  29.63 
 
 
318 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  27.45 
 
 
305 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5020  phospholipase/Carboxylesterase  24.66 
 
 
563 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.780509  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3190  hypothetical protein  26.53 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00525581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  22.05 
 
 
410 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  26.17 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  31.34 
 
 
1010 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  28.95 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  22.97 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  26.47 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  23.45 
 
 
254 aa  43.9  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  26.04 
 
 
338 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  22.97 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  25.49 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  22.58 
 
 
464 aa  43.5  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  25.49 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  28.33 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2969  hypothetical protein  25 
 
 
324 aa  42.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  28.57 
 
 
301 aa  42.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  26.62 
 
 
312 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  27.73 
 
 
306 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>