More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1937 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1937  two component transcriptional regulator, LuxR family  100 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  71 
 
 		 204 aa  278  4e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4572  two component transcriptional regulator, LuxR family  71.64 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  0.115695 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0286  two component transcriptional regulator, LuxR family  69.5 
 
 		 203 aa  255  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.784033  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4753  two component transcriptional regulator, LuxR family  64.18 
 
 		 201 aa  247  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.226774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4055  response regulator receiver protein  65.67 
 
 		 201 aa  245  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0367887 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0195  two component LuxR family transcriptional regulator  68 
 
 		 205 aa  238  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.116105 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1720  LuxR family two component transcriptional regulator  64.18 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2068  two component transcriptional regulator, LuxR family  58 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385073  normal  0.894995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0763  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.7 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1641  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.19 
 
 		 201 aa  222  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  58.5 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0907  LuxR family two component transcriptional regulator  57.71 
 
 		 197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5200  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.22 
 
 		 223 aa  219  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0156716  normal  0.415255 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  55.22 
 
 		 201 aa  218  5e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16250  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  60.5 
 
 		 224 aa  212  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.216822  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4598  response regulator receiver protein  54.73 
 
 		 201 aa  212  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.053163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 201 aa  208  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00990  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  57.71 
 
 		 201 aa  207  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.666199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06340  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  53.55 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  53.73 
 
 		 197 aa  204  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8146  response regulator receiver protein  53.96 
 
 		 202 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0091  response regulator receiver protein  52.48 
 
 		 204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.520551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1808  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.23 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.207018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 205 aa  197  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 200 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  191  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6441  response regulator receiver protein  52.24 
 
 		 227 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176234  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3654  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.25 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0345388 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0655  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.75 
 
 		 200 aa  187  8e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.23 
 
 		 201 aa  187  9e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  44.28 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 200 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2770  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.77 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.282039  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0691  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.63 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3820  two component LuxR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113202  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  181  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  42.79 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5034  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.617082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5444  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5477  DNA-binding response regulator  43.28 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00156963  hitchhiker  0.00000000000102018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1264  two component LuxR family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.86401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3534  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.57 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0183  two component LuxR family transcriptional regulator  51.24 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.541303  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0588  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.5 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3506  two component LuxR family transcriptional regulator  45 
 
 		 198 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2543  two component LuxR family transcriptional regulator  48.76 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.446643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02200  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11510  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  45.81 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.575058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  48.26 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.680692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4591  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 198 aa  168  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000001788 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1908  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.77 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.264232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0503  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.900292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7316  response regulator receiver protein  49.25 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0357  two component transcriptional regulator, LuxR family protein  43.63 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4836  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.74 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.16538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0347  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0345  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 198 aa  161  6e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0355  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.5 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.881439  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0352  two component LuxR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0351  LuxR family DNA-binding response regulator  44.5 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0322  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.27 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1079  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.0499592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3621  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3818  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3475  response regulator receiver  43.81 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03365  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  39 
 
 		 205 aa  150  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4334  response regulator receiver protein  45.77 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574495  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1897  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.3 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.299419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3614  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.28 
 
 		 201 aa  144  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.765091  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2037  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 225 aa  143  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.137578 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1290  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.29796  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  40.47 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4508  response regulator receiver protein  42.99 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401356  normal  0.568133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 221 aa  141  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0645  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.691779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0767  LuxR response regulator receiver  42.25 
 
 		 221 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.88397  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.55 
 
 		 222 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0889  LuxR family DNA-binding response regulator  33.83 
 
 		 200 aa  138  6e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000916195  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  39.81 
 
 		 215 aa  137  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.76 
 
 		 218 aa  137  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4551  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.38 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.2 
 
 		 239 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5893  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.12 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3601  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.324048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  38.43 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.47 
 
 		 224 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>