47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1856 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1856  hypothetical protein  100 
 
 		 739 aa  1487    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0763554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2702  hypothetical protein  56.35 
 
 		 348 aa  369  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000025037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36540  hypothetical protein  55.21 
 
 		 324 aa  348  2e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01090  Ig-like domain-containing protein  43.84 
 
 		 583 aa  266  8.999999999999999e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14440  hypothetical protein  44.19 
 
 		 323 aa  251  5e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01100  hypothetical protein  30.34 
 
 		 992 aa  243  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02590  hypothetical protein  42.02 
 
 		 345 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0816  endo-1,4-beta-xylanase  41.43 
 
 		 318 aa  218  2.9999999999999998e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1511  surface protein  29.64 
 
 		 1065 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.36671  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  35.29 
 
 		 982 aa  170  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2076  hypothetical protein  35.6 
 
 		 314 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07781  arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00650)  35.13 
 
 		 340 aa  164  7e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.621545 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08472  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 		 346 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.327023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  31.86 
 
 		 478 aa  137  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1354  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1139 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3471  hypothetical protein  32.56 
 
 		 274 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1805  hypothetical protein  31.34 
 
 		 300 aa  111  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00065967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3438  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.14 
 
 		 316 aa  110  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0527524  normal  0.0695696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  32.35 
 
 		 3320 aa  110  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4606  glycoside hydrolase family 43  31.11 
 
 		 675 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.337279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 644 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2119  hypothetical protein  29 
 
 		 304 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4087  hypothetical protein  30.88 
 
 		 305 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  37.09 
 
 		 846 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2785  hypothetical protein  27.72 
 
 		 311 aa  95.1  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0402448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  28.73 
 
 		 1121 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2023  hypothetical protein  25.15 
 
 		 342 aa  79.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131758  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  33.48 
 
 		 739 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  33.03 
 
 		 739 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  25.97 
 
 		 1112 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 1121 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3223  putative beta-xylosidase  26.8 
 
 		 377 aa  73.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.222849  normal  0.126141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  26.92 
 
 		 1121 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 1013 aa  72  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  27.37 
 
 		 1143 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  43.68 
 
 		 848 aa  70.9  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  30.59 
 
 		 757 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  31.54 
 
 		 1174 aa  66.2  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  32.02 
 
 		 767 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  27.95 
 
 		 3507 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3927  Ricin B lectin  26.06 
 
 		 436 aa  58.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  37.18 
 
 		 718 aa  53.9  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0623  protein of unknown function DUF291  33.83 
 
 		 2205 aa  50.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.578825  unclonable  0.00000000542423 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  36.84 
 
 		 926 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01850  Ig-like domain-containing protein  24.47 
 
 		 1323 aa  48.5  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.854355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0850  hypothetical protein  34.78 
 
 		 428 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0290611  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  24.64 
 
 		 252 aa  43.9  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>